More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1102 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
271 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  59.62 
 
 
271 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  58.65 
 
 
267 aa  273  2e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1813  phosphomethylpyrimidine kinase  56.44 
 
 
275 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.319911  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  56.42 
 
 
260 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
268 aa  245  5e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4475  phosphomethylpyrimidine kinase  54.1 
 
 
259 aa  245  5e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341855  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
288 aa  243  2e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2132  phosphomethylpyrimidine kinase  57.75 
 
 
282 aa  240  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.588203  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
268 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.91 
 
 
268 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0552  phosphomethylpyrimidine kinase  52.47 
 
 
269 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00628299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
270 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  52.14 
 
 
492 aa  235  5e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
288 aa  234  1e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  53.49 
 
 
490 aa  234  1e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  50.55 
 
 
288 aa  234  1e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4126  phosphomethylpyrimidine kinase  57.25 
 
 
266 aa  234  2e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67736e-05 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  49.03 
 
 
267 aa  234  2e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 
270 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1204  phosphomethylpyrimidine kinase  58.8 
 
 
269 aa  232  4e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.980352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.46 
 
 
263 aa  232  4e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  55.43 
 
 
484 aa  231  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.96 
 
 
268 aa  232  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  53.1 
 
 
497 aa  231  7e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  55.56 
 
 
308 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  52.16 
 
 
264 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 
497 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
269 aa  230  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 
283 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  47.06 
 
 
265 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  52.92 
 
 
484 aa  226  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1921  phosphomethylpyrimidine kinase  58.04 
 
 
267 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.613535  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  50.74 
 
 
271 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.51 
 
 
268 aa  226  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  52.36 
 
 
269 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  52.63 
 
 
267 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.25 
 
 
260 aa  222  4e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  52.31 
 
 
280 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
270 aa  222  5e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  48.26 
 
 
494 aa  221  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
270 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  49.42 
 
 
264 aa  221  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
270 aa  221  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.15 
 
 
285 aa  221  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 
269 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 
270 aa  220  2e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.10773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.95 
 
 
265 aa  220  2e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  47.89 
 
 
270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  50.78 
 
 
274 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  51.14 
 
 
267 aa  219  4e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
266 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  45.31 
 
 
264 aa  218  8e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  55.87 
 
 
267 aa  218  9e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  50.2 
 
 
264 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  54.23 
 
 
267 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  47.13 
 
 
273 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  41.22 
 
 
269 aa  217  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
266 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  45.7 
 
 
264 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  53.85 
 
 
267 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  52.9 
 
 
285 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
262 aa  215  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
270 aa  215  6e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  41.18 
 
 
273 aa  215  6e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
265 aa  215  6e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  52.33 
 
 
304 aa  215  6e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.85 
 
 
272 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2438  phosphomethylpyrimidine kinase  49.61 
 
 
264 aa  215  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.674981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  43.63 
 
 
267 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 
268 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 
277 aa  214  1e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
266 aa  214  1e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2787  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
268 aa  213  2e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0741888  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  51.34 
 
 
297 aa  214  2e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 
266 aa  213  3e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  51.94 
 
 
291 aa  213  3e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  51.54 
 
 
268 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.14 
 
 
270 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  51.01 
 
 
295 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
266 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  52.53 
 
 
479 aa  210  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  48.47 
 
 
271 aa  210  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  45.74 
 
 
268 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
266 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  47.27 
 
 
267 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  46.15 
 
 
273 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  53.21 
 
 
287 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
266 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>