More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0215 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.31 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  43.01 
 
 		 286 aa  186  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.46 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  38.31 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  35.71 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  32.65 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  29.39 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  31.83 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  29.21 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  30.28 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.37 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  29.69 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  29.55 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.55 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  29.43 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.08 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  29.45 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  27.07 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.07 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.81 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.6 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.26 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.81 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  27.03 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.18 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  25.91 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  28.36 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  33.83 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  25.45 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  22.78 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  28.25 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  28.25 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  28.25 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  28.25 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  29.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  25.8 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  27.89 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  28.24 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  27.82 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.53 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  26.55 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  27.04 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  26.76 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  27.1 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  24.66 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  25.96 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  32.24 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.17 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2647  hypothetical protein  27.55 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.176077 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  27.59 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  25.17 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  27.21 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  27.59 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.79 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.19 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  27.21 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  29.11 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  26.56 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  29.52 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  28.19 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1125  hypothetical protein  28.07 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  30.34 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  29.52 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>