More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4426 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4559  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0669727  normal  0.0839611 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4426  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0192  response regulator transcription regulator protein  95.35 
 
 		 215 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.028731 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  73.02 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1216  two component LuxR family transcriptional regulator  69.3 
 
 		 215 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.86 
 
 		 215 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 215 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 215 aa  279  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 215 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  61.97 
 
 		 215 aa  277  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 214 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 215 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  275  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 215 aa  274  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  61.03 
 
 		 282 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  60.47 
 
 		 215 aa  272  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  60 
 
 		 215 aa  270  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  60 
 
 		 215 aa  270  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  60 
 
 		 215 aa  270  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.15 
 
 		 216 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  58.14 
 
 		 215 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 216 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  58.88 
 
 		 215 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 215 aa  247  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5330  two component LuxR family transcriptional regulator  59.13 
 
 		 215 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3499  two component LuxR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  49.77 
 
 		 235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1146  response regulator receiver  67.09 
 
 		 209 aa  208  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 209 aa  184  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  44.23 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  44.02 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  43.81 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  43.06 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0615  LuxR family DNA-binding response regulator  47.12 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26011  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1290  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.542915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2347  GerE family regulatory protein  47.12 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.925531  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1047  LuxR family DNA-binding response regulator  47.12 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1132  LuxR family DNA-binding response regulator  47.12 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0853  LuxR family DNA-binding response regulator  47.12 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1818  LuxR family DNA-binding response regulator  47.12 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204731  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 239 aa  177  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 209 aa  175  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  43.54 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1971  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 271 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1634  LuxR family DNA-binding response regulator  46.19 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>