74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4922 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  81.78 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  73.12 
 
 		 256 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  66.39 
 
 		 292 aa  347  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  63.92 
 
 		 258 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  61.92 
 
 		 275 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  58.63 
 
 		 254 aa  284  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  53.78 
 
 		 255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  56.45 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  52.02 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  51.21 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  51 
 
 		 259 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49.61 
 
 		 276 aa  248  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  47.66 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  49.8 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  47.01 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  48.44 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  44.7 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  43.94 
 
 		 264 aa  218  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  47.56 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  42.8 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  38.16 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  38.4 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  32.84 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.2 
 
 		 587 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32.4 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  33.2 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  35.32 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  32 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  31.62 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.71 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  31.05 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.03 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.03 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.59 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  26.02 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  29.74 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.13 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  39.32 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  29.54 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  25.88 
 
 		 268 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  22.79 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  32.48 
 
 		 366 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  28.69 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  25.74 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  28.69 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  23.55 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.71 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  29.18 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  28.69 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  27.78 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  33.04 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  31.3 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  33.04 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  24.45 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  33.85 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  24.45 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  26.78 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  26.25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  25.09 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  26.89 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  25.35 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  27.2 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  26.39 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  27.64 
 
 		 369 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  27.35 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  33.67 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  27.64 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  27.64 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  32.23 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  30.7 
 
 		 478 aa  42.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  27.27 
 
 		 369 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.18 
 
 		 262 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>