More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0786 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 		 334 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  87.69 
 
 		 335 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  87.93 
 
 		 335 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.73 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.75 
 
 		 344 aa  318  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.15 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.92 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.14 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  51.76 
 
 		 345 aa  315  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.34 
 
 		 344 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.8 
 
 		 344 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.41 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.85 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.51 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.05 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  49.85 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.42 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 		 344 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.85 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.71 
 
 		 359 aa  285  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.67 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.43 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.41 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  51.31 
 
 		 350 aa  276  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.83 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  47.43 
 
 		 348 aa  268  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.11 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.48 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.32 
 
 		 354 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.73 
 
 		 343 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.73 
 
 		 343 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.06 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.02 
 
 		 363 aa  258  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.9 
 
 		 357 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.22 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  46.43 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.94 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.84 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.61 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.61 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.61 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.61 
 
 		 357 aa  255  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.61 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.61 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.13 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.56 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  44.19 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.24 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.15 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  49.71 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.4 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.86 
 
 		 358 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.06 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.4 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  50.74 
 
 		 350 aa  248  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  45.76 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.98 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  40.69 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  44.84 
 
 		 357 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.78 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.2 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  45.06 
 
 		 346 aa  235  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  42.33 
 
 		 369 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.33 
 
 		 369 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  42.33 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  42.61 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.61 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.33 
 
 		 362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  41.86 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.51 
 
 		 349 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.48 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.76 
 
 		 362 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  41.11 
 
 		 371 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  39.34 
 
 		 381 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  40.29 
 
 		 364 aa  219  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  33.62 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  33.93 
 
 		 354 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  33.33 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  35.38 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  37.88 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  37.39 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.6 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.6 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.45 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.11 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.83 
 
 		 404 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  35.78 
 
 		 323 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  36.21 
 
 		 377 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.37 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.21 
 
 		 326 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.78 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  40.48 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.52 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 		 393 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03750  hypothetical protein  33.98 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.32469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  43.19 
 
 		 343 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  43.2 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.88 
 
 		 374 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  42.65 
 
 		 358 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.55 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>