More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0223 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  87.64 
 
 		 259 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  86.05 
 
 		 259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  79.07 
 
 		 259 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  78.54 
 
 		 261 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  77.56 
 
 		 260 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.54 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  56.91 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  57.83 
 
 		 258 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  56.61 
 
 		 263 aa  308  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  57.09 
 
 		 263 aa  305  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  54.33 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  58.7 
 
 		 257 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  56.4 
 
 		 263 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  55.51 
 
 		 258 aa  295  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  56.3 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  55.6 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  55.6 
 
 		 263 aa  292  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  55.2 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  55.2 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  55.2 
 
 		 263 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  57.14 
 
 		 263 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  54.8 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  54.92 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  54.8 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.7 
 
 		 263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  55.87 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  55.47 
 
 		 262 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.47 
 
 		 262 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.27 
 
 		 263 aa  286  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  56.4 
 
 		 258 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.66 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.06 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.06 
 
 		 262 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.51 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.15 
 
 		 263 aa  278  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.41 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  53.31 
 
 		 249 aa  274  9e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 		 263 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  52.23 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  54.55 
 
 		 249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  55 
 
 		 263 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  50.82 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.18 
 
 		 262 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  51.48 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  53.7 
 
 		 255 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  53.7 
 
 		 255 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  53.49 
 
 		 215 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  53.91 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.57 
 
 		 239 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  42.06 
 
 		 234 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  37.01 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.07 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  36.68 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.55 
 
 		 240 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  34.25 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  35.78 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  38.59 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  36.21 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  35.71 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  36.21 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.81 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  32.17 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.66 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  35.69 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.15 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  31.87 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  32.13 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.31 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  39.13 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  30.62 
 
 		 315 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  30.62 
 
 		 315 aa  125  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.24 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 319 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.33 
 
 		 501 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  29.03 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.07 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  28.27 
 
 		 495 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.02 
 
 		 517 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.25 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.79 
 
 		 199 aa  92  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.5 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  30.35 
 
 		 374 aa  90.1  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.33 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.58 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.67 
 
 		 200 aa  88.2  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.82 
 
 		 331 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.74 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.61 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.23 
 
 		 318 aa  85.5  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0382  oxidoreductase molybdopterin binding  29.53 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.761682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1488  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.725964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.65 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5298  oxidoreductase molybdopterin binding  28.31 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.8 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2579  oxidoreductase molybdopterin binding  33.56 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3614  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.98 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507139  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.65 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.46 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1229  oxidoreductase molybdopterin binding  30.57 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00326003  normal  0.661197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>