More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5979 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5979  cation diffusion facilitator CzcD  100 
 
 		 316 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000910181  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1761  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 316 aa  634    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0169574  normal  0.529338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  63.27 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05200  putative cation efflux system protein  63.61 
 
 		 299 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2584  cation diffusion facilitator family transporter  60.9 
 
 		 312 aa  345  7e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3473  cation diffusion facilitator family transporter  64 
 
 		 319 aa  329  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0026  CDF family cobalt/cadmium/zinc transporter  56.9 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000390702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.9 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0040  cation diffusion facilitator family transporter  56.9 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0043  cation diffusion facilitator family transporter  56.9 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.307096 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01708  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  55.35 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1983  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  51.51 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.644974  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1912  cation diffusion facilitator family transporter  51.51 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114222  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1196  cation diffusion facilitator family transporter  52.9 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2218  cation diffusion facilitator family transporter  54.9 
 
 		 297 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0353679 
 
 
-
 
NC_004310  BR0498  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  57.04 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0501  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  57.04 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0340413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7268  cation efflux system protein czcD  51.16 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.571769  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0215  cation diffusion facilitator family transporter  53.87 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6782  cation diffusion facilitator family transporter  46.5 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337377  normal  0.84699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1074  cation diffusion facilitator family transporter  49.64 
 
 		 305 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4086  cation diffusion facilitator family transporter  51.64 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2286  cation diffusion facilitator family transporter  46.34 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.76035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2131  cation diffusion facilitator family transporter  46.34 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.127518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3642  cation diffusion facilitator family transporter  47.32 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  normal  0.259615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2211  cation diffusion facilitator family transporter  45.7 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1771  cation efflux family protein  43.55 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  43.21 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1630  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3571  cation efflux family protein  42.86 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1889  cation efflux family protein  42.86 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0368031  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  42.09 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1581  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.51 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1607  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  42.86 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0977421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3389  cation diffusion facilitator family transporter  42.18 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.400984 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1629  cation efflux family protein  42.51 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1756  cation efflux family protein  42.51 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0464766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1148  cation diffusion facilitator family transporter  44.69 
 
 		 340 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.280865  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0595  cation efflux protein  40.21 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1806  cation efflux family protein  41.96 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0171  cation diffusion facilitator family transporter  43.42 
 
 		 307 aa  218  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6162  cation diffusion facilitator family transporter  44.88 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0389  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0184  cation diffusion facilitator family transporter  43.49 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.421209  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30010  cation diffusion facilitator family transporter  44.52 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000713084  normal  0.287518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2216  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1191  cation diffusion facilitator family transporter  39.66 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0594  cation diffusion facilitator family transporter  41.26 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.987975  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13910  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 303 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1802  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0909  cation diffusion facilitator family transporter  39.11 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0096451  hitchhiker  0.0000000000204317 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1136  cation diffusion facilitator family transporter  39.3 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3496  cation diffusion facilitator family transporter  42.19 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3631  cation diffusion facilitator family transporter  44.59 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.492249  decreased coverage  0.00000526062 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0545  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1452  zinc transporter ZitB  41.91 
 
 		 378 aa  211  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00926601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0487  cation efflux family protein  39.24 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1370  cation diffusion facilitator family transporter  39.38 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  41.37 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0525  cation diffusion facilitator family transporter  43.21 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4034  cation diffusion facilitator family transporter  38.41 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1014  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0149205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3226  cation diffusion facilitator family transporter  40.54 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  44.01 
 
 		 356 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0610  cation diffusion facilitator family transporter  41.31 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2008  cation diffusion facilitator family transporter  35.69 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0398491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  38.14 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2198  cation diffusion facilitator family transporter  39.57 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2300  cation efflux protein  45.82 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1344  cation diffusion facilitator family transporter  44.22 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.123489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0712  cation diffusion facilitator family transporter  39.56 
 
 		 301 aa  202  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0868  cation diffusion facilitator family transporter  40.29 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3763  cation efflux family protein  41.88 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2220  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.157536  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2182  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0067  cation diffusion facilitator transporter family protein  37.85 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1243  zinc transporter ZitB  38.31 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00653762  normal  0.610782 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0039  cation efflux protein  36.81 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.747433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3071  cation efflux protein  38.99 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4444  cation diffusion facilitator family transporter  41.45 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4059  cation diffusion facilitator family transporter  40.5 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.552828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4582  cation diffusion facilitator family transporter  35.19 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2470  cation diffusion facilitator family transporter  40.55 
 
 		 310 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.843602  normal  0.377619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1582  cation diffusion facilitator family transporter  39.62 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.496669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0978  cation diffusion facilitator family transporter  37.75 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0892489  normal  0.0362171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1806  cation diffusion facilitator family transporter  38.78 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1756  cation efflux family protein  36.99 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.799686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0452  cation diffusion facilitator family transporter  40.36 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0402588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0328  cation diffusion facilitator family transporter  40.99 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3011  cation diffusion facilitator family transporter  37.85 
 
 		 347 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2863  zinc transporter ZitB  36.91 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00819873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0974  cation diffusion facilitator family transporter  37.5 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1405  zinc transporter ZitB  36.91 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2951  zinc transporter ZitB  36.91 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.278393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3783  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6519  cation diffusion facilitator family transporter  40.38 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0672  zinc transporter ZitB  39.93 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00307439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1900  cation efflux family protein  35.94 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2062  cation diffusion facilitator family transporter  38.66 
 
 		 342 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.118305  normal  0.587349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>