More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1841 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  82.76 
 
 
145 aa  258  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  68.71 
 
 
149 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  68.03 
 
 
149 aa  209  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  65.99 
 
 
149 aa  206  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  57.86 
 
 
148 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  53.19 
 
 
154 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
138 aa  151  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  51.05 
 
 
154 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  53.24 
 
 
289 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.41 
 
 
285 aa  147  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
287 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 
287 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  47.52 
 
 
292 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  48.92 
 
 
288 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.55 
 
 
289 aa  137  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  47.48 
 
 
287 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  45.39 
 
 
286 aa  130  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  44.6 
 
 
287 aa  124  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.29 
 
 
141 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.69 
 
 
153 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.56 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.1 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  40.16 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.94 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.58 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.51 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.15 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.37 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.38 
 
 
161 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.38 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.43 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.07 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.07 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.82 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.83 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.59 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  31.62 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  31.62 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  31.62 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  31.62 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  31.62 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  31.62 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  31.62 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.23 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.88 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.67 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.46 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3950  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.12 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0822744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3837  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  26.12 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.488766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.15 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  29.92 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  39.76 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.91 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.58 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  29.69 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.3 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>