More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1424 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1544  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 186 aa  145  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1495  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.403846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1344  hypothetical protein  41.42 
 
 		 265 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.321071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6545  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0982  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 177 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76015  normal  0.0931916 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1677  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.855535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1221  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5000  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20966  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3899  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3513  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.200164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3586  NUDIX hydrolase  38.15 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0673  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0055  NUDIX hydrolase  32.4 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1222  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3745  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 178 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  33.92 
 
 		 195 aa  94.4  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 169 aa  91.3  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  32.74 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 187 aa  88.2  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 204 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  31.55 
 
 		 176 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 171 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  37.27 
 
 		 210 aa  84.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  33.73 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  33.73 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  34.62 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  32.69 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0830  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.66661  normal  0.255619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  32.14 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.16 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2258  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1622  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>