More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0994 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  100 
 
 		 382 aa  768    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.9 
 
 		 390 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  38.52 
 
 		 379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  39.84 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.87 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.37 
 
 		 379 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  42.48 
 
 		 433 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  42.71 
 
 		 373 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  42.33 
 
 		 380 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  37.3 
 
 		 376 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  39.95 
 
 		 374 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  39.57 
 
 		 366 aa  245  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  37.14 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  38.32 
 
 		 371 aa  242  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  39.08 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  36.58 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  39.95 
 
 		 395 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  38.81 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.87 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  38.86 
 
 		 365 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  42.25 
 
 		 369 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.04 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  37.23 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  40.11 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  37.7 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  36.77 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  36.78 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.47 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  36.34 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  39.52 
 
 		 382 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.06 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.55 
 
 		 386 aa  228  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  37.83 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1946  alanine racemase  39.4 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  37 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  36.68 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.54 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  38.79 
 
 		 380 aa  223  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.03 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.64 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  38.9 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  37.37 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  32.64 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  32.72 
 
 		 392 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.38 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  38.82 
 
 		 390 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  33.95 
 
 		 379 aa  219  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.64 
 
 		 391 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.81 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  38.64 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.35 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.25 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  32.81 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  33.25 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  40.59 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1885  alanine racemase  41.34 
 
 		 397 aa  215  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.849261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  32.81 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.73 
 
 		 373 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  32.81 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.51 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  39.47 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.16 
 
 		 398 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  36.83 
 
 		 376 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  36.27 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  35.04 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  40.53 
 
 		 382 aa  209  8e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.37 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1498  alanine racemase  33.68 
 
 		 378 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2818  alanine racemase  38.01 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2441  alanine racemase  38.01 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.75 
 
 		 375 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  34.29 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.88 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  40.88 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0191  alanine racemase  37.81 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  37.84 
 
 		 851 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  39.16 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.34 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0233  putative bifunctional UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide:D-alanyl-D-alanine ligase/alanine racemase  34.47 
 
 		 834 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  39.53 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  36.69 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  36.15 
 
 		 395 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0357  alanine racemase  37.5 
 
 		 400 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  37.63 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  35.88 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  36.03 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  36.03 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  35.88 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  37.07 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.41 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  35.28 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  35.28 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  35.28 
 
 		 383 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  37.23 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  33.24 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  38.11 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  35.62 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  32.51 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  37.37 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1331  alanine racemase  38.95 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>