More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4457 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4457  patatin  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  75.56 
 
 		 313 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  73.47 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  69.8 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  69.46 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  61.43 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  59.57 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  54.29 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  45.39 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  48.48 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  43.43 
 
 		 310 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  40.42 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  36.86 
 
 		 277 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  35.69 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  34.69 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  34.07 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  33.33 
 
 		 332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  32.54 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  40.48 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  32.72 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  32.54 
 
 		 276 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  37.91 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.93 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  36.08 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  27.52 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  26.5 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  36.41 
 
 		 335 aa  99.8  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  40.24 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  34.24 
 
 		 311 aa  99.4  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  31.45 
 
 		 317 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  34.81 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  34.24 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  30.65 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  30.8 
 
 		 262 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.24 
 
 		 293 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.52 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.65 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  35.48 
 
 		 349 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.87 
 
 		 323 aa  95.5  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  34.41 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  33.87 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  33.87 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  33.87 
 
 		 305 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  33.33 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  35.05 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.84 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  36.02 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  30.56 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  25.26 
 
 		 760 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.41 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.87 
 
 		 474 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.39 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.39 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  27.34 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  33.87 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  29.91 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.15 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  33.7 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.37 
 
 		 358 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.87 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  33.7 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.51 
 
 		 263 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.87 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  30.6 
 
 		 266 aa  92.8  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  32.31 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.27 
 
 		 263 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.87 
 
 		 306 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  26.95 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.52 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.52 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  33.52 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.52 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  30.43 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.97 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.87 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.97 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  25.87 
 
 		 728 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  37.08 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  28.47 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  35.36 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  32.7 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  29.93 
 
 		 790 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  36.7 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  32.97 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  32.8 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  25.98 
 
 		 741 aa  90.9  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.68 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  35.29 
 
 		 748 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  32.97 
 
 		 263 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  34.76 
 
 		 322 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  34.24 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  35.42 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  35.29 
 
 		 347 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  35.29 
 
 		 347 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.42 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  31.98 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  35.71 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  36.11 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25 
 
 		 740 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>