More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2585 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  51.38 
 
 
871 aa  850    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  58.69 
 
 
741 aa  856    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  59.28 
 
 
727 aa  836    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  82.52 
 
 
886 aa  1437    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  61.09 
 
 
751 aa  883    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  100 
 
 
878 aa  1769    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  43.92 
 
 
856 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  56.88 
 
 
723 aa  809    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  56.03 
 
 
723 aa  788    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  62.95 
 
 
755 aa  840    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  64.93 
 
 
746 aa  926    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  60.69 
 
 
748 aa  804    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  60.94 
 
 
722 aa  847    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  55.72 
 
 
727 aa  783    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  56.03 
 
 
730 aa  808    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  59.15 
 
 
743 aa  841    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  82.52 
 
 
886 aa  1437    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  89.13 
 
 
883 aa  1548    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  58.88 
 
 
744 aa  799    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  61 
 
 
730 aa  859    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  43.24 
 
 
856 aa  629  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  42 
 
 
896 aa  627  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  42.42 
 
 
858 aa  621  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  42.74 
 
 
875 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  44.12 
 
 
855 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  42.91 
 
 
865 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  44.12 
 
 
855 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  42.62 
 
 
856 aa  602  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  43.74 
 
 
855 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  41.84 
 
 
856 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  44.38 
 
 
862 aa  595  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  42.47 
 
 
861 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  42.47 
 
 
861 aa  592  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  41.44 
 
 
857 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  42.36 
 
 
855 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  43.71 
 
 
861 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  42.42 
 
 
890 aa  580  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  42 
 
 
879 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.08 
 
 
876 aa  571  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.52 
 
 
894 aa  568  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  39.31 
 
 
895 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  38.68 
 
 
894 aa  549  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  38.95 
 
 
906 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  38.59 
 
 
877 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 
877 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  42.48 
 
 
872 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.64 
 
 
879 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39.53 
 
 
908 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  38.58 
 
 
914 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.1 
 
 
901 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  38.05 
 
 
918 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  37.59 
 
 
902 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.92 
 
 
885 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.28 
 
 
900 aa  513  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  35.09 
 
 
882 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  35.08 
 
 
893 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  37.21 
 
 
910 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  34.81 
 
 
887 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  36.27 
 
 
939 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.28 
 
 
881 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  31.37 
 
 
874 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  31.53 
 
 
874 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.33 
 
 
622 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  28.52 
 
 
636 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  28.54 
 
 
637 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.89 
 
 
647 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.53 
 
 
664 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  29.48 
 
 
646 aa  171  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.59 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.55 
 
 
778 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.88 
 
 
778 aa  163  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.37 
 
 
573 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  36.42 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  35.74 
 
 
579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.5 
 
 
755 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.79 
 
 
755 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
1103 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  30.09 
 
 
538 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  36.14 
 
 
569 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.8 
 
 
757 aa  141  7e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.98 
 
 
585 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.6 
 
 
571 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  36.81 
 
 
594 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  31.79 
 
 
328 aa  138  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.33 
 
 
754 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  32.39 
 
 
597 aa  136  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
593 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  33.96 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  33.64 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  33.96 
 
 
581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
588 aa  135  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  32.4 
 
 
572 aa  133  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  27.62 
 
 
584 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  34.78 
 
 
585 aa  132  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  34.26 
 
 
581 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
594 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
594 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
594 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.13 
 
 
584 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>