More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2062 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  81.53 
 
 
314 aa  508  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2807  hypothetical protein  33.1 
 
 
312 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  28.08 
 
 
313 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  31.39 
 
 
311 aa  146  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  29.9 
 
 
309 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  31.54 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  30 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  35.52 
 
 
294 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.08 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  30.8 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  30.68 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  35.61 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  37.16 
 
 
280 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.12 
 
 
283 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1494  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.99 
 
 
296 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3228  hypothetical protein  28.96 
 
 
320 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.17 
 
 
319 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  27.48 
 
 
290 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  28.23 
 
 
314 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  27.76 
 
 
319 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  26.27 
 
 
337 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 
309 aa  99  9e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  28.21 
 
 
319 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  23.99 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  27.38 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  28.32 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  28.14 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  27 
 
 
300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.34 
 
 
306 aa  93.2  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  27.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  27.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  27.67 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0108  hypothetical protein  24.8 
 
 
308 aa  92.4  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000248564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  27.67 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1306  hypothetical protein  28.36 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0753003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  27.27 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  28.33 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  27.39 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  23.53 
 
 
307 aa  90.5  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  28.27 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  27.8 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0109  alpha/beta fold family hydrolase  23.84 
 
 
311 aa  89  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000692138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5445  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.47 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  24.71 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0385  hypothetical protein  34.57 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  28.25 
 
 
424 aa  82.4  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2612  hypothetical protein  25.52 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0809624  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2298  hypothetical protein  25.52 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  29.21 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  25.59 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  31.63 
 
 
285 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  32.2 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  24.91 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  31.89 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0384  hypothetical protein  22.99 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  35.71 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0659  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  30.77 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13780  alpha/beta hydrolase family protein  29.6 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  30.43 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0126  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.95 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2579  hypothetical protein  26.23 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.121751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  31.77 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.07 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  27.17 
 
 
276 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  26.67 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  27.31 
 
 
648 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  25.89 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0215  hydrolase of the alpha/beta superfamily  24.07 
 
 
316 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000127658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.28 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  30.36 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0392  hypothetical protein  26.63 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.280774  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0739  hypothetical protein  29.27 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  24.11 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  27.17 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  26.4 
 
 
298 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8252  hypothetical protein  28.12 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  25.88 
 
 
282 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
285 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  25.72 
 
 
298 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6175  hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.35 
 
 
298 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  28.29 
 
 
277 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl315  lysophospholipase  19.53 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.71518e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2435  putative hydrolase  29.63 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0653999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1390  hypothetical protein  24.22 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  26.97 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0720  hypothetical protein  29.67 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0935769  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6824  dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  29.03 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  26.43 
 
 
359 aa  59.3  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>