More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2257 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  100 
 
 		 306 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  97.39 
 
 		 306 aa  584  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  87.91 
 
 		 306 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  60.46 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  62.09 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  59.48 
 
 		 308 aa  361  8e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  63.4 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  59.48 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  60.78 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  61.69 
 
 		 309 aa  351  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  58.5 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  58.5 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  60.46 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  57.52 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  57.93 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  40.07 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  44.44 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  43.65 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  44.66 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  47.59 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  44.44 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  42.95 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  42.48 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  42.77 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  43.23 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  39.55 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  42.16 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  38.59 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  39.23 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  39.5 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  41.72 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  41.03 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  40.13 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  36.16 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  38.06 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  36.68 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  41.92 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  37.06 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  37.86 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  35.37 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 319 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  37.38 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  37.38 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  35.87 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 335 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.91 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  36.86 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.01 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  37.94 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  35.86 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  35.06 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  33.01 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  36.1 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  34.54 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.22 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  32.7 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  34.59 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.66 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  33.84 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  36.74 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  35.78 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.21 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.55 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  34.04 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.18 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.81 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  30.23 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  35.85 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 331 aa  112  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  30.32 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.71 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  32.69 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.2 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  39.77 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  39.77 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  39.77 
 
 		 302 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  39.02 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  37.85 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>