More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1527 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  54.02 
 
 		 1125 aa  1040    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  100 
 
 		 1106 aa  2160    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  98.82 
 
 		 1106 aa  2132    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  50.71 
 
 		 1120 aa  975    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  57.83 
 
 		 1121 aa  1139    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  90.55 
 
 		 1119 aa  1874    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  53.83 
 
 		 1124 aa  981    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  39.85 
 
 		 1156 aa  621  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  40.15 
 
 		 1157 aa  607  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  38.1 
 
 		 1156 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2020  double-strand break repair helicase AddA  38.04 
 
 		 1180 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.411715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2103  UvrD/Rep family helicase  38.14 
 
 		 1180 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.664576  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  37.58 
 
 		 1159 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  39.13 
 
 		 1161 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0629  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 1161 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.590503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  38.24 
 
 		 1180 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0058  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 		 1162 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.106754  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  38.26 
 
 		 1164 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0387  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 1164 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 		 1187 aa  545  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  32.98 
 
 		 1155 aa  545  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3300  double-strand break repair helicase AddA  40.57 
 
 		 1167 aa  536  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.107239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  37.87 
 
 		 1185 aa  532  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0050  UvrD/REP helicase  36.08 
 
 		 1202 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.253682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.3 
 
 		 1177 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  37.25 
 
 		 1183 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  38.29 
 
 		 1183 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  36.99 
 
 		 1183 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0157  UvrD/REP helicase  37.81 
 
 		 1166 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.271961  normal  0.551574 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  35.93 
 
 		 1189 aa  506  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1412  double-strand break repair helicase AddA  36.96 
 
 		 1151 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  36.65 
 
 		 1161 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3377  double-strand break repair helicase AddA  39.22 
 
 		 1165 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.291395  normal  0.767589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  37.8 
 
 		 1147 aa  479  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4904  double-strand break repair helicase AddA  37.8 
 
 		 1147 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.921527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  38.6 
 
 		 1182 aa  475  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4440  double-strand break repair helicase AddA  37.54 
 
 		 1147 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.548671  normal  0.292809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  38.88 
 
 		 1157 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  29.89 
 
 		 1089 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  37.58 
 
 		 1157 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1455  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.48 
 
 		 1157 aa  413  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.719405  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 854 aa  402  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.67 
 
 		 860 aa  390  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2681  double-strand break repair helicase AddA  40.51 
 
 		 1142 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  35.64 
 
 		 1147 aa  281  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  30.15 
 
 		 1173 aa  243  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 1173 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1177 aa  235  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 1173 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.29 
 
 		 1197 aa  211  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0467  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.26 
 
 		 907 aa  209  2e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  28.7 
 
 		 1187 aa  201  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  28.4 
 
 		 1168 aa  195  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 1087 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1061 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  28.46 
 
 		 1140 aa  173  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 1165 aa  171  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0033  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.18 
 
 		 1089 aa  171  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 1101 aa  169  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1285  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  30.86 
 
 		 1086 aa  162  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.100578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 1101 aa  161  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  23.69 
 
 		 1074 aa  158  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  28.56 
 
 		 1115 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 1110 aa  155  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.78 
 
 		 1139 aa  154  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 1080 aa  147  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 1149 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.91 
 
 		 1207 aa  146  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.96 
 
 		 1242 aa  146  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 		 1117 aa  145  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1131 aa  145  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 1185 aa  145  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.24 
 
 		 1241 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.08 
 
 		 1241 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  26.47 
 
 		 1226 aa  139  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1057 aa  138  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  29.1 
 
 		 1242 aa  137  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  26.05 
 
 		 1054 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  23.22 
 
 		 1218 aa  134  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.05 
 
 		 1230 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  23.52 
 
 		 1248 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  24.78 
 
 		 1217 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  24.78 
 
 		 1217 aa  129  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1904  exodeoxyribonuclease V, 135 kDa subunit  26.81 
 
 		 1208 aa  129  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  29.89 
 
 		 1107 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.93 
 
 		 1203 aa  128  5e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  24.55 
 
 		 1217 aa  128  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  26.16 
 
 		 1392 aa  127  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  25.26 
 
 		 921 aa  127  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  24.22 
 
 		 1110 aa  127  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 1121 aa  126  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.42 
 
 		 1240 aa  126  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.99 
 
 		 1226 aa  125  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.53 
 
 		 1168 aa  125  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1986  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.97 
 
 		 1209 aa  124  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259297  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2265  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 1095 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  24.11 
 
 		 1110 aa  123  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  26.19 
 
 		 915 aa  122  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1169  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.87 
 
 		 1269 aa  121  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2193  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 1103 aa  121  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>