113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1900 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1900  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  339  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1759  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1493  protein of unknown function DUF892  47.56 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2899  protein of unknown function DUF892  46.34 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2776  hypothetical protein  47.47 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3003  protein of unknown function DUF892  47.47 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5805  protein of unknown function DUF892  56.83 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0300343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0605  hypothetical protein  49.68 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0688  hypothetical protein  46.88 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0583127  normal  0.153854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1355  hypothetical protein  36.71 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1857  hypothetical protein  42.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.53745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1920  hypothetical protein  42.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252481  hitchhiker  0.0000515566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1862  YciE  42.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.898538 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1416  YciE  42.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1598  hypothetical protein  42.58 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5650  hypothetical protein  37.97 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5519  hypothetical protein  39.04 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.445596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0139  protein of unknown function DUF892  40 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207704  normal  0.0800225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01231  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2391  protein of unknown function DUF892  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01241  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1366  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1455  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2370  hypothetical protein  42 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.454918  hitchhiker  0.000000143978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4046  hypothetical protein  38.31 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1888  hypothetical protein  41.33 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0168584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3115  hypothetical protein  39.04 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3128  hypothetical protein  40.67 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.137847 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4157  hypothetical protein  39.24 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3795  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2257  hypothetical protein  37.67 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0390342  normal  0.0993659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0330  hypothetical protein  39.04 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.600353  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1646  protein YciE  38.67 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3797  protein of unknown function DUF892  38.71 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3829  hypothetical protein  34.19 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3516  hypothetical protein  34.93 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11100  hypothetical protein  32.19 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3123  YciE  34.93 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.220644  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2998  YciE  34.93 
 
 		 289 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.272257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1349  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932547  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3554  protein of unknown function DUF892  32.68 
 
 		 161 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1353  hypothetical protein  34.93 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6476  hypothetical protein  34.93 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5471  hypothetical protein  34.01 
 
 		 169 aa  72  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6066  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184002  normal  0.0421173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  32.87 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2857  hypothetical protein  33.1 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1875  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000212933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  33.78 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  32.72 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  27.66 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  26.09 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  29.57 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  27.54 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  26.57 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  28.97 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  30.67 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  30.08 
 
 		 421 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  30.71 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2282  protein of unknown function DUF892  26.11 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  25.5 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  26.71 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  29.58 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  28.57 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  32.11 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  33.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  33.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  33.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  33.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  33.06 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  27.4 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  30.09 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  33.06 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1452  hypothetical protein  28.48 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.311216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4547  hypothetical protein  25.62 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  33 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  25.66 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  29.91 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  30.48 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  32.23 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  31.19 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  32.23 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  31.19 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  27.1 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  31.19 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  29.73 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  28.37 
 
 		 217 aa  44.3  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  43.9  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  26.81 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  25.88 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  28.37 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  25.29 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  26.03 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>