119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5596 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5596  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  330  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.756785  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5614  protein of unknown function DUF892  81.48 
 
 		 168 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.255585 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5592  protein of unknown function DUF892  78.53 
 
 		 166 aa  256  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.544575  hitchhiker  0.00495302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4540  protein of unknown function DUF892  73.58 
 
 		 165 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.369842 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3491  hypothetical protein  70 
 
 		 163 aa  236  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4275  protein of unknown function DUF892  71.07 
 
 		 165 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4791  hypothetical protein  70.44 
 
 		 165 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1136  hypothetical protein  67.27 
 
 		 165 aa  228  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1730  hypothetical protein  69.23 
 
 		 165 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.666521  decreased coverage  0.00187959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1446  hypothetical protein  68.07 
 
 		 165 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4247  protein of unknown function DUF892  72.44 
 
 		 166 aa  210  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3563  hypothetical protein  70.51 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.892765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3526  hypothetical protein  61.01 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4912  hypothetical protein  68.94 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1737  hypothetical protein  70.51 
 
 		 166 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.997374  normal  0.0699743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2984  hypothetical protein  62.66 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602458 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2670  hypothetical protein  64.74 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0525668  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4295  hypothetical protein  66.04 
 
 		 167 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3294  hypothetical protein  62.35 
 
 		 163 aa  190  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.335875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0740  hypothetical protein  60.38 
 
 		 192 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7975  protein of unknown function DUF892  60.93 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2220  protein of unknown function DUF892  61.84 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3057  hypothetical protein  63.98 
 
 		 165 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.460854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5257  protein of unknown function DUF892  60.49 
 
 		 162 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0289  protein of unknown function DUF892  56.79 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.302406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2664  hypothetical protein  66.03 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.104786  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1820  hypothetical protein  62.11 
 
 		 169 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0468  hypothetical protein  62.11 
 
 		 165 aa  176  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.53229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4293  protein of unknown function DUF892  59.87 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3906  protein of unknown function DUF892  55.68 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3614  hypothetical protein  55.11 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2862  protein of unknown function DUF892  54.88 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.217094  normal  0.674493 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9043  hypothetical protein  56.96 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.034068  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1470  hypothetical protein  50.94 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0321654  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0993  protein of unknown function DUF892  52.15 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4465  protein of unknown function DUF892  50.94 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3827  hypothetical protein  64.23 
 
 		 149 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2066  hypothetical protein  51.2 
 
 		 195 aa  160  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0139243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1033  hypothetical protein  52.53 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.665565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4845  protein of unknown function DUF892  50.31 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00641789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5546  hypothetical protein  50.94 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376366  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1633  hypothetical protein  60.67 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.351952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1657  hypothetical protein  52.83 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448276  normal  0.877202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3218  hypothetical protein  53.8 
 
 		 167 aa  153  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.708155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3832  hypothetical protein  52.2 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4071  hypothetical protein  52.26 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4247  hypothetical protein  54.25 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0753724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4862  hypothetical protein  54.09 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5347  protein of unknown function DUF892  54.09 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4780  hypothetical protein  50.65 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5401  protein of unknown function DUF892  55.35 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2390  protein of unknown function DUF892  50.92 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421917  normal  0.147329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2659  hypothetical protein  51.03 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1856  hypothetical protein  49.4 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.542717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1417  protein YciF  49.4 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1727  protein of unknown function DUF892  48.47 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000459015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1308  protein of unknown function DUF892  48.47 
 
 		 191 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.758326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6464  hypothetical protein  52.83 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255827  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3730  protein of unknown function DUF892  48.45 
 
 		 169 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4833  protein of unknown function DUF892  50 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3365  hypothetical protein  48.41 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.430964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01232  hypothetical protein  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2390  protein of unknown function DUF892  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0588252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01242  hypothetical protein  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1367  YciF protein  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.177269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1456  YciF protein  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000775316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2369  hypothetical protein  50.3 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.820184  hitchhiker  0.000000156892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1874  YciF protein  50.3 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1889  YciF protein  50.3 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0111142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1919  hypothetical protein  48.8 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  0.0000284113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1861  protein YciF  48.8 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.919479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1599  hypothetical protein  48.8 
 
 		 167 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0036  hypothetical protein  50.34 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130409 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1678  hypothetical protein  51.28 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0088  ycfI, putative structural proteins  50.64 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3623  hypothetical protein  47.83 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0183446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1724  hypothetical protein  50.64 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3127  hypothetical protein  49.08 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2256  hypothetical protein  45.96 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1647  YciF protein  48.15 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3141  hypothetical protein  47.06 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51971  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1370  protein of unknown function DUF892  44.65 
 
 		 168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2287  hypothetical protein  49.06 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2487  protein of unknown function DUF892  46.84 
 
 		 247 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48482  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2646  hypothetical protein  45.22 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3186  hypothetical protein  48.47 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5097  hypothetical protein  48.78 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5840  protein of unknown function DUF892  69.39 
 
 		 253 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4158  protein of unknown function DUF892  42.5 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5574  protein of unknown function DUF892  42.17 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0196  hypothetical protein  44.9 
 
 		 169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2545  hypothetical protein  43.87 
 
 		 168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  47.68 
 
 		 421 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1026  hypothetical protein  46.71 
 
 		 187 aa  120  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.158329  hitchhiker  0.000105516 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1599  protein of unknown function DUF892  43.23 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0568744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3344  protein of unknown function DUF892  42.04 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0480671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2773  protein of unknown function DUF892  39.61 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2297  hypothetical protein  42.76 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5857  protein of unknown function DUF892  35 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0615276  normal  0.702479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3586  protein of unknown function DUF892  41.55 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>