More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3022 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  100 
 
 		 155 aa  318  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  98.71 
 
 		 155 aa  313  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  78.71 
 
 		 159 aa  259  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  58.28 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  55.84 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  55.84 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  55.84 
 
 		 156 aa  183  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  55.84 
 
 		 159 aa  183  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  52.6 
 
 		 157 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  52.6 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  51.33 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  51.37 
 
 		 166 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  45.95 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0740  regulatory proteins, AsnC/Lrp  46.36 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  43.92 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  45.7 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0007  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 169 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 156 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  43.05 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  49.65 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  49.65 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  49.65 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  43.33 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0850  glutamate uptake regulatory protein Grp  45.03 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  42.67 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 198 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000530  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.809718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  42 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 198 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1780  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152537  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 198 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 282 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  43.59 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03485  regulatory protein, AsnC/Lrp  42.21 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  44.22 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  43.59 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 177 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  43.79 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  41.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>