More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2434 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  100 
 
 		 312 aa  630  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  93.59 
 
 		 312 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  67.52 
 
 		 312 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  65.92 
 
 		 315 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  64.1 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  63.78 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  61.22 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  56.91 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  58.97 
 
 		 323 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  46.93 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  42.21 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  43.65 
 
 		 312 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  37.82 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  37.94 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  35.58 
 
 		 308 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  35.26 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  37.5 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  37.94 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  35.69 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  35.37 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  39.23 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  38.61 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  37.18 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  37.62 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  36.1 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.39 
 
 		 326 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  34.73 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.02 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  33.97 
 
 		 303 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  34.62 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  35.03 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  35.13 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  32.59 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  31.66 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.28 
 
 		 323 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  33.12 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  37.34 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  34.19 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  126  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  32.7 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.13 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  30.59 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  34.74 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  34.63 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  33.96 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  34.48 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  32.76 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  35.23 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.79 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  30.91 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  33.78 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  32.38 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  31.72 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  31.41 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0544  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.54 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  31.95 
 
 		 346 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.94 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.67 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.15 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05325  sugar kinase protein  32.91 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.244562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  35.29 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 		 319 aa  102  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.52 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.12 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>