More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3012 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  88.76 
 
 		 180 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  87.71 
 
 		 180 aa  330  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  88.2 
 
 		 179 aa  329  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  86.59 
 
 		 180 aa  321  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  68.54 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  66.85 
 
 		 179 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  64.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  64.25 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  59.78 
 
 		 186 aa  217  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  57.87 
 
 		 183 aa  213  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  58.99 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  57.87 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  56.74 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  57.3 
 
 		 182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  56.74 
 
 		 182 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  56.74 
 
 		 182 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  57.3 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  56.18 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  55.56 
 
 		 199 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  52.87 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  54.29 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  54.02 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  52.57 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  54.49 
 
 		 204 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  49.72 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  48.28 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  49.15 
 
 		 197 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  46.37 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  49.72 
 
 		 190 aa  177  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  46.37 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  48.26 
 
 		 191 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  51.96 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3443  PfpI family intracellular peptidase  50.86 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  49.43 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  47.49 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  46.29 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  46.33 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  47.49 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  47.06 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  47.54 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  44.83 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6770  intracellular protease, PfpI family  49.14 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.21709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  46.37 
 
 		 183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  47.95 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  45.76 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  45.76 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  43.65 
 
 		 194 aa  160  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  44.07 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  43.82 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  44.38 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  44.44 
 
 		 185 aa  157  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  45.25 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 245 aa  157  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  41.9 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  41.9 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  42.94 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5584  PfpI family intracellular peptidase  45.51 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  40.45 
 
 		 188 aa  154  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  42.94 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  46.78 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0160  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.7 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  41.67 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  40.57 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  48.3 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  44.38 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  42.86 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  42.31 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  41.32 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3335  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.14 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0951  peptidase C56, PfpI  42.86 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  42.29 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  41.04 
 
 		 241 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  42.61 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  45.45 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  45.45 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  44.07 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  41.62 
 
 		 192 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  43.17 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  41.62 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  45.11 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  40.91 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  40.34 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  44.19 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  40.46 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  40.91 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  44.09 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  41.76 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  40.59 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  39.66 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  41.46 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  41.46 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  38.01 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  43.17 
 
 		 197 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  40.35 
 
 		 194 aa  130  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  40.98 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  39.89 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>