More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1311 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  97.98 
 
 		 704 aa  1386    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  85.71 
 
 		 693 aa  1233    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  97.26 
 
 		 693 aa  1379    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  84.7 
 
 		 704 aa  1218    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 693 aa  1409    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  88.76 
 
 		 705 aa  1268    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  77.49 
 
 		 693 aa  1116    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  76.22 
 
 		 699 aa  1108    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  77.19 
 
 		 698 aa  1113    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  0.00000629787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  76.12 
 
 		 704 aa  1106    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  97.98 
 
 		 704 aa  1386    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  49.13 
 
 		 721 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  47.73 
 
 		 703 aa  623  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  46.2 
 
 		 698 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  47.18 
 
 		 698 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1593  C-terminal processing peptidase-1  44.8 
 
 		 708 aa  544  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  42.19 
 
 		 709 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  43.03 
 
 		 709 aa  536  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  44.55 
 
 		 668 aa  529  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  43.12 
 
 		 665 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  43.33 
 
 		 679 aa  521  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 		 690 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  43.48 
 
 		 664 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  45.65 
 
 		 693 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  43.24 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  44.22 
 
 		 672 aa  512  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  42.57 
 
 		 681 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  44.65 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  43.47 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  43.47 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  44.49 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  42.71 
 
 		 697 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  44.49 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  44.56 
 
 		 678 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  43.33 
 
 		 682 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  44.19 
 
 		 682 aa  505  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  43.02 
 
 		 725 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  42.53 
 
 		 673 aa  504  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  43.3 
 
 		 683 aa  505  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000352033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  43.47 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  43.47 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  44.49 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  43.47 
 
 		 682 aa  503  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 		 705 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  41.71 
 
 		 682 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2440  carboxy-terminal protease  43.36 
 
 		 681 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  42.53 
 
 		 671 aa  502  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2447  carboxy-terminal protease  43.36 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  42.68 
 
 		 707 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  43.37 
 
 		 690 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  43.36 
 
 		 681 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  42.32 
 
 		 719 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  43.52 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  43.52 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1778  carboxy-terminal protease  43.26 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0159186 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  45.17 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  41.03 
 
 		 727 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  41.03 
 
 		 727 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  43.51 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  43.29 
 
 		 692 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  43.22 
 
 		 681 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  43.29 
 
 		 690 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  40.94 
 
 		 681 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  40.37 
 
 		 683 aa  495  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0729  peptidase S41A, C-terminal protease  43.5 
 
 		 683 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  41.02 
 
 		 681 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  41.81 
 
 		 671 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  43.29 
 
 		 689 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1673  carboxy-terminal protease  42.81 
 
 		 683 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1748  carboxy-terminal protease  42.81 
 
 		 683 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0158568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  41.38 
 
 		 673 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  43.42 
 
 		 694 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  42.2 
 
 		 697 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  41.68 
 
 		 712 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  43.16 
 
 		 682 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  40.94 
 
 		 681 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  42.88 
 
 		 664 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  41.76 
 
 		 680 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  43.09 
 
 		 674 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  42.39 
 
 		 688 aa  478  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  41.84 
 
 		 687 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  42 
 
 		 674 aa  464  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  39 
 
 		 706 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  41.04 
 
 		 675 aa  458  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  38.43 
 
 		 683 aa  432  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  34.72 
 
 		 737 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  34.72 
 
 		 737 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  34.06 
 
 		 735 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0003  carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 702 aa  376  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3496  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 743 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.847425  normal  0.281142 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1631  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 		 748 aa  349  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1430  carboxyl-terminal protease  33.95 
 
 		 727 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  35.02 
 
 		 706 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  36.72 
 
 		 719 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  33.18 
 
 		 711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  28.95 
 
 		 676 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  32.89 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  33.01 
 
 		 649 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>