250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2179 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  607  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  69.51 
 
 
322 aa  427  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  68.93 
 
 
310 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  64.07 
 
 
310 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  59.64 
 
 
310 aa  339  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  50.83 
 
 
333 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  45.6 
 
 
333 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  50 
 
 
330 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  47.33 
 
 
311 aa  265  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  46.58 
 
 
319 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  46.34 
 
 
573 aa  263  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  43.71 
 
 
313 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  45.97 
 
 
305 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  46.82 
 
 
334 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  45.97 
 
 
316 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  43.65 
 
 
316 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  43.14 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  42.81 
 
 
316 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  42.81 
 
 
316 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  42.81 
 
 
316 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  46.89 
 
 
284 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  47 
 
 
316 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  47 
 
 
316 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  47 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  41.5 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  43.05 
 
 
326 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  46.07 
 
 
318 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  44.37 
 
 
310 aa  230  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  44.95 
 
 
331 aa  215  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  44.81 
 
 
314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0351  hypothetical protein  47.47 
 
 
328 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  42.91 
 
 
315 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0378  hypothetical protein  47.72 
 
 
328 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0369  hypothetical protein  47.72 
 
 
328 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.799177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  38.76 
 
 
328 aa  165  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  35.52 
 
 
335 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  36.5 
 
 
335 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  37.23 
 
 
335 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  40.09 
 
 
344 aa  135  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  37.37 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  28.31 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  30.95 
 
 
380 aa  122  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  30.66 
 
 
360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  30.66 
 
 
360 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  31.88 
 
 
341 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  30.42 
 
 
339 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  40.12 
 
 
377 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  29.73 
 
 
352 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  27.41 
 
 
338 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  27.61 
 
 
354 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  31.14 
 
 
355 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29.17 
 
 
324 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  27.95 
 
 
348 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  29.49 
 
 
355 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1881  hypothetical protein  34.8 
 
 
347 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  34.72 
 
 
351 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  25.52 
 
 
331 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  28.01 
 
 
340 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  29.43 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.42 
 
 
352 aa  99  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  26.91 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.42 
 
 
340 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.97 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.09 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  28.91 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.97 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1279  hypothetical protein  28.62 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  24.24 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  24.24 
 
 
331 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  32.65 
 
 
343 aa  95.9  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2875  hypothetical protein  27.65 
 
 
331 aa  95.5  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  27.34 
 
 
390 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  26.96 
 
 
359 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  30.96 
 
 
341 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3510  hypothetical protein  28.57 
 
 
331 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  25.18 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  31.42 
 
 
340 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  30.53 
 
 
352 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  24.71 
 
 
327 aa  92  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  28.33 
 
 
345 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  31.15 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  28.93 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  27.46 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  27.07 
 
 
357 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.28 
 
 
340 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  29.13 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  32.08 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  32.08 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  32.08 
 
 
362 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  33.02 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  27.88 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  26.69 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.81 
 
 
349 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>