More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0252 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  100 
 
 		 337 aa  678    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  77.51 
 
 		 337 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  76.88 
 
 		 343 aa  498  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  77.78 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  80 
 
 		 338 aa  482  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  68.71 
 
 		 327 aa  442  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  70.19 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.46 
 
 		 334 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  55.79 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  54.41 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  56.4 
 
 		 332 aa  330  3e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.12 
 
 		 340 aa  325  9e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  54.77 
 
 		 337 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  52.48 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  55.08 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  54.94 
 
 		 435 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  54.63 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  55.62 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  50.58 
 
 		 346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.25 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  54.87 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 353 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.27 
 
 		 434 aa  301  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  51.34 
 
 		 338 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50 
 
 		 427 aa  299  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.09 
 
 		 417 aa  299  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.44 
 
 		 350 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.76 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 347 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  53.35 
 
 		 333 aa  298  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  52.01 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  51.23 
 
 		 337 aa  296  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.9 
 
 		 463 aa  295  5e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.94 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.98 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  49.28 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  52.31 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  52.48 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  52.31 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  51.69 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.01 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50.9 
 
 		 357 aa  292  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.8 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  55.21 
 
 		 419 aa  291  7e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.81 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  48.63 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 338 aa  289  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  51.5 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 397 aa  288  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.15 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  47.74 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.66 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  51.08 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 373 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  52.62 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.54 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 354 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.2 
 
 		 369 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  51.05 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.06 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 363 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  51.38 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  54.45 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.76 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  47.16 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  47.11 
 
 		 350 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 354 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  51.88 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  51.36 
 
 		 345 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 438 aa  281  8.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4213  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.57 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 366 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.51 
 
 		 407 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  48.26 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>