173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1501 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  283  6e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  48.12 
 
 
129 aa  144  4e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  46.72 
 
 
130 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  128  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  42.86 
 
 
132 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  50.44 
 
 
136 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  47.86 
 
 
130 aa  127  4e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  43.44 
 
 
130 aa  127  4e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  40.32 
 
 
132 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  40.98 
 
 
132 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  42.15 
 
 
132 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  34.85 
 
 
132 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  38.52 
 
 
128 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  36.21 
 
 
133 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  31.01 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  34.81 
 
 
319 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  29.69 
 
 
136 aa  81.3  4e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  31.25 
 
 
136 aa  80.1  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  79.7  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  34 
 
 
131 aa  79.7  1e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  31.16 
 
 
149 aa  78.2  3e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  78.6  3e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  29.03 
 
 
141 aa  78.2  4e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  77.4  5e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.56 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.37 
 
 
137 aa  76.6  1e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.56 
 
 
138 aa  76.6  1e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  31.13 
 
 
127 aa  75.5  2e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  29.69 
 
 
319 aa  75.5  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.56 
 
 
138 aa  75.5  2e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  30.08 
 
 
138 aa  75.1  3e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  75.5  3e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.7 
 
 
132 aa  74.7  4e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  74.7  4e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  74.3  5e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  28.33 
 
 
148 aa  74.3  5e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  30.19 
 
 
127 aa  74.3  6e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  31.25 
 
 
146 aa  74.3  6e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.37 
 
 
137 aa  73.9  7e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  29.06 
 
 
135 aa  73.6  8e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  31.78 
 
 
135 aa  73.6  8e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  34.17 
 
 
120 aa  73.6  8e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  29.27 
 
 
135 aa  72.4  2e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  71.2  4e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.41 
 
 
131 aa  70.9  6e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  30.08 
 
 
143 aa  69.7  1e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  31.19 
 
 
129 aa  68.9  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  68.9  2e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  29.46 
 
 
143 aa  68.9  2e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  29.09 
 
 
315 aa  68.2  4e-11  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  68.2  4e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  32.06 
 
 
321 aa  67.8  5e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  26.23 
 
 
139 aa  67.4  7e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  28.93 
 
 
152 aa  66.2  1e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  31.03 
 
 
311 aa  66.2  1e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  28.1 
 
 
548 aa  66.2  1e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  25.83 
 
 
139 aa  66.6  1e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  28.93 
 
 
152 aa  66.2  1e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28.93 
 
 
146 aa  65.5  2e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  26.61 
 
 
120 aa  65.9  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.27 
 
 
137 aa  65.1  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  28.1 
 
 
548 aa  63.9  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  27.36 
 
 
134 aa  63.9  8e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.81 
 
 
144 aa  63.5  9e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0317  protein of unknown function DUF35  30.97 
 
 
124 aa  62.8  1e-09  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  26.96 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  25.58 
 
 
138 aa  62.8  2e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.08 
 
 
142 aa  62.4  2e-09  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  29.06 
 
 
132 aa  62.8  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  30.11 
 
 
305 aa  61.6  3e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  26.45 
 
 
152 aa  62  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  61.6  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  30.85 
 
 
145 aa  61.2  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31.53 
 
 
130 aa  61.2  4e-09  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  60.8  5e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  27.87 
 
 
136 aa  60.8  5e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  60.8  5e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  29.73 
 
 
145 aa  60.8  5e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  25.42 
 
 
134 aa  59.7  1e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  2.62786e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  26.85 
 
 
140 aa  60.1  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  26.5 
 
 
132 aa  59.3  2e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  27.35 
 
 
146 aa  59.3  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  29.63 
 
 
176 aa  58.9  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  27.73 
 
 
550 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  27.12 
 
 
123 aa  58.5  3e-08  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  27.73 
 
 
550 aa  58.5  3e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  27.73 
 
 
550 aa  57.8  5e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  31.11 
 
 
119 aa  57.4  7e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0854  protein of unknown function DUF35  31.07 
 
 
116 aa  57  8e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0219431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  25.38 
 
 
136 aa  57  9e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  57  9e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  26.19 
 
 
140 aa  56.6  1e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>