More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1559 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 148 aa  307  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  86.3 
 
 		 149 aa  268  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  86.39 
 
 		 148 aa  266  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5818  3-dehydroquinate dehydratase  82.22 
 
 		 146 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546847 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5767  3-dehydroquinate dehydratase  77.78 
 
 		 145 aa  239  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.533207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6025  3-dehydroquinate dehydratase  78.26 
 
 		 147 aa  233  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212804  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4434  3-dehydroquinate dehydratase  77.3 
 
 		 145 aa  233  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3003  3-dehydroquinate dehydratase  76.43 
 
 		 145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216438  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  75 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  74.32 
 
 		 149 aa  226  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  69.57 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  69.47 
 
 		 149 aa  196  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  64.23 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.07 
 
 		 144 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4099  3-dehydroquinate dehydratase  76.77 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0790869  normal  0.677158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.09 
 
 		 145 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  53.74 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.72 
 
 		 145 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  48.09 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 207 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  47.1 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.45 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 207 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 207 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  46.27 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.28 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  49.28 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2391  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 145 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  49.23 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.72 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  46.67 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.32 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  45.93 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  46.32 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  45.99 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  43.07 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.65 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 148 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  43.07 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  43.8 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  45.26 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  43.38 
 
 		 150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  43.8 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 		 151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  47.06 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  45.19 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  43.07 
 
 		 151 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  44.7 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.1 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  43.48 
 
 		 149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  45.32 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.26 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  44.53 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>