83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0598 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 504 aa  1047    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  24.21 
 
 		 441 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  24.75 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  24.31 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  22.77 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  24.16 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  24.25 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  21.87 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.75 
 
 		 452 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  23.86 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  24.65 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  24.65 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  23.37 
 
 		 434 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  24.6 
 
 		 437 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  23.82 
 
 		 438 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  23.11 
 
 		 437 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  21.87 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  22.51 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.05 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  22.31 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  22.31 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  23.61 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  22.31 
 
 		 437 aa  91.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  22.44 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  23.54 
 
 		 469 aa  90.5  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  23.68 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  22.35 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  26.75 
 
 		 475 aa  87.4  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  21.05 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  22.64 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  28.92 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  22.2 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  20.36 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  23.06 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  24.41 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  28.85 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  27.27 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.97 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  26.01 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  22.75 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  26.54 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  27.45 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  19.6 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.39 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  27.96 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  29.15 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  26.88 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.95 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  29.47 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  20.86 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  21.69 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25.65 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  22.98 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.66 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  20.59 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  29.08 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  26.15 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  21.31 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  26.42 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  27.51 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.94 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  23.57 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  20.68 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  25.77 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  25.26 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  25.79 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2244  hypothetical protein  21.07 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  27.69 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2272  hypothetical protein  20.77 
 
 		 642 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  28.24 
 
 		 376 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  23.04 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  29.1 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  34.52 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  23.5 
 
 		 378 aa  48.5  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.81 
 
 		 642 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.16 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  24.59 
 
 		 489 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  21.46 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>