More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3541 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3541  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.62234  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2953  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 		 244 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.549446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0092  glycosyl transferase family protein  45.02 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0975573  normal  0.193732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  33.77 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 380 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 		 255 aa  85.9  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.71 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0763  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.855183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  36.9 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2785  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  31.28 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.06 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5474  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.19 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224375 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45980  predicted protein  28.74 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00043599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.54 
 
 		 780 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3900  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 246 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.93 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.82 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.04 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34317  dolichol phosphate glucosyltransferase  27.08 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.96 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.45 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1658  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 563 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  25.1 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.38 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.04 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0731  family 2 glycosyl transferase  25.1 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.0143344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 571 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  26.44 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.61 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 567 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2679  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0184474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4193  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.109349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  29.9 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2675  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 		 552 aa  59.7  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.61 
 
 		 809 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14980  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 410 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  28.41 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 368 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  29.17 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  29.17 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  29.17 
 
 		 444 aa  58.9  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  25.28 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.9 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.42 
 
 		 536 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  28.98 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1328  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0827685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6086  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>