More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0230 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0230  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000828379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4211  ornithine carbamoyltransferase  60.47 
 
 		 301 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4122  ornithine carbamoyltransferase  60.47 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3715  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 		 301 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.523544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4012  ornithine carbamoyltransferase  60.13 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.875127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4093  ornithine carbamoyltransferase  59.47 
 
 		 301 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0238  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 		 301 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0258  ornithine carbamoyltransferase  60.67 
 
 		 301 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3707  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3903  ornithine carbamoyltransferase  59.14 
 
 		 301 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0277  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0193  ornithine carbamoyltransferase  58.8 
 
 		 301 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0331  ornithine carbamoyltransferase  57.95 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0204  ornithine carbamoyltransferase  56.81 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4274  ornithine carbamoyltransferase  57.95 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242541  normal  0.315958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0252  ornithine carbamoyltransferase  57.48 
 
 		 301 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0229  ornithine carbamoyltransferase  58.47 
 
 		 301 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0980  ornithine carbamoyltransferase  53.85 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00530  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0462  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  42.58 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  41.88 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  43.85 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  41.12 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  42.24 
 
 		 314 aa  254  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  40.33 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 		 312 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  41.53 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  41.53 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0182  ornithine carbamoyltransferase  46.79 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.533049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  40.39 
 
 		 340 aa  245  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  40.85 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  44.15 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  43.96 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  40.39 
 
 		 316 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  44.15 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  39.93 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  40.72 
 
 		 316 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  40.73 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 		 316 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  40.73 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  40.72 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2889  ornithine carbamoyltransferase  40.66 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  40.72 
 
 		 316 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  39.46 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  39.68 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0354  ornithine carbamoyltransferase  43.84 
 
 		 304 aa  237  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.140894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  41.23 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0092  ornithine carbamoyltransferase  39.22 
 
 		 313 aa  236  4e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.371923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  39.6 
 
 		 305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  38.39 
 
 		 302 aa  235  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  41.18 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28754  Ornithine carbamoyltransferase  39.41 
 
 		 312 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  39.6 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  38.41 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  40.2 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1807  ornithine carbamoyltransferase  40.52 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  hitchhiker  0.00296151 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  39.29 
 
 		 310 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  38.36 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  37.42 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  37.38 
 
 		 310 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  40.2 
 
 		 303 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1605  ornithine carbamoyltransferase  36.63 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.416404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  38.82 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  37.13 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  41.79 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  38.03 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  40.81 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  38.59 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1731  ornithine carbamoyltransferase  40.27 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  38.56 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  38.11 
 
 		 305 aa  225  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  40.62 
 
 		 305 aa  225  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  39.07 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  41.51 
 
 		 312 aa  224  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  38.74 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  37.95 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1323  ornithine carbamoyltransferase  42.16 
 
 		 338 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1334  ornithine carbamoyltransferase  42.07 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0126096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  40.37 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  38.03 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1073  ornithine carbamoyltransferase  42.11 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  35.41 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  38.54 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1380  ornithine carbamoyltransferase  40.82 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  38.54 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  40.46 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  38.89 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  40.3 
 
 		 315 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1046  ornithine carbamoyltransferase  40.15 
 
 		 330 aa  221  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  38.46 
 
 		 355 aa  221  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19151  ornithine carbamoyltransferase  37.42 
 
 		 318 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1203  ornithine carbamoyltransferase  37.21 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0366728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>