236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2179 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2179  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.509167  normal  0.553697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3285  protein of unknown function UPF0029  51.76 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.897292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12728  hypothetical protein  47.74 
 
 		 203 aa  191  8e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2223  protein of unknown function UPF0029  45.13 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.238524  normal  0.0468847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1632  protein of unknown function UPF0029  44.9 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  40.45 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0003  hypothetical protein  49.71 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606692  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0124  hypothetical protein  40.51 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000265032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  36.46 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  36.02 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.29 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  35.06 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  45.53 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1009  hypothetical protein  36.2 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0286427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  33.14 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1375  hypothetical protein  32.8 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000270637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1121  hypothetical protein  35.58 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.490437  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  31.12 
 
 		 205 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0034  hypothetical protein  31.35 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0046667  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  35.84 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  34.18 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  35.26 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  36.81 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  31.12 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  35.84 
 
 		 194 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  32.24 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1413  hypothetical protein  32.28 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.533633  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  33.67 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  35.9 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  38.99 
 
 		 290 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  31.67 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  43.9 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  36.69 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  34.09 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  34.09 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  43.09 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  32.37 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  38.04 
 
 		 239 aa  99  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.78 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0775164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  42.02 
 
 		 225 aa  99  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.53 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  35.98 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0020  hypothetical protein  33.74 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  33.53 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  35.71 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  34.18 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  34.18 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0020  hypothetical protein  32.45 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0743784  hitchhiker  0.000738865 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  34.18 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  31.87 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  33.77 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  37.76 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0023  hypothetical protein  32.2 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  hitchhiker  0.000952494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1010  hypothetical protein  37.74 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1720  hypothetical protein  37.74 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0445948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  27.81 
 
 		 206 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0279  hypothetical protein  37.74 
 
 		 303 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  36.24 
 
 		 207 aa  94.7  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0289  hypothetical protein  37.74 
 
 		 303 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0488253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1307  hypothetical protein  37.74 
 
 		 303 aa  94.4  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.441803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  36.52 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0518  protein of unknown function UPF0029  41.94 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.8 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0026  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0810004  hitchhiker  0.0000000252745 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  28.89 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  32.56 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  32.91 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  33.54 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  33.52 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0903  protein of unknown function UPF0029  36.95 
 
 		 213 aa  93.2  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.30398 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  32.22 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1571  hypothetical protein  36.07 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0018  hypothetical protein  31.91 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464651  normal  0.0620683 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1726  protein of unknown function UPF0029  45.45 
 
 		 216 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  30.05 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1805  hypothetical protein  41.01 
 
 		 303 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  28.5 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  29.89 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  31.76 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0383  hypothetical protein  36.96 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.46169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  38.35 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0142  protein of unknown function UPF0029  32.5 
 
 		 196 aa  91.7  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  32.5 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  34.59 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  37.9 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  32.48 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  29.89 
 
 		 222 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0015  hypothetical protein  31.14 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.536697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  32.1 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  32.28 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  36.17 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>