More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0739 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0739  ribosomal protein S6  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0945845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  61.54 
 
 		 126 aa  153  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2591  30S ribosomal protein S6  55.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1114  ribosomal protein S6  54.7 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263419  normal  0.860444 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  54.46 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  54.72 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3482  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09978  30S ribosomal protein S6  51 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.410175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6993  ribosomal protein S6  47.62 
 
 		 116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.140903 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0399  30S ribosomal protein S6  44.72 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  37.61 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  35.19 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  43.62 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1660  30S ribosomal protein S6  35.58 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1689  ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  34.23 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  34.74 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  33.66 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  34.02 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 96 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0665  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0012  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 107 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142702  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  37.08 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1830  ribosomal protein S6  31.07 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.776664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  32.29 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  26.88 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0007  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000068559  hitchhiker  0.0000000000002413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0007  30S ribosomal protein S6  31.18 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0165  ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0139  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  35.11 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  31.25 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1772  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1481  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3669  30S ribosomal protein S6  30.95 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  29.17 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  31.58 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0891  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  0.483607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1412  30S ribosomal protein S6  27.96 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000404173  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1352  30S ribosomal protein S6  30.93 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0105388  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  28.72 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  30.43 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30071  30S ribosomal protein S6  30.34 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.319395 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0044  30S ribosomal protein S6  30 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2677  30S ribosomal protein S6  31.46 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  30.77 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  27.08 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0424  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  30.85 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  28.26 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0413  30S ribosomal protein S6  31.63 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000259691  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  33.98 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1438  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0054631  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  29.35 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  34.83 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0451  30S ribosomal protein S6  32.58 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000202528  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  30.85 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  31.91 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>