More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0466 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  71.62 
 
 		 228 aa  325  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  54.46 
 
 		 238 aa  211  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  51.57 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  50.91 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  39.25 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  43.15 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  41.47 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  38.71 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  38.83 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.33 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  37.77 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  37.5 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  37.5 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  35.94 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  41.21 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  37.21 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  36.87 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  36.51 
 
 		 238 aa  124  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  36.81 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.24 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  35.45 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0166  ABC transporter related  40.11 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  35.42 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.98 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  35.45 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.82 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  41.01 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.55 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  36.71 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  43.5 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  40.68 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  37.97 
 
 		 264 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 239 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  38.33 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 249 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 247 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  36.16 
 
 		 277 aa  117  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 227 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  34.07 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2113  ABC transporter related  37.91 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000000136112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  35.29 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  38.86 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  38.42 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  38.33 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  40 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  36.26 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  38.29 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  36.26 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  41.24 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.61 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  35.94 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  35.87 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  32.99 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  37.31 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  42.7 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 253 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3354  predicted ATPase involved in cell division FtsE  41.01 
 
 		 218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  34.07 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>