193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2335 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2335  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 309 aa  635    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2032  ABC zinc transporter, periplasmic solute binding protein ZnuA  85.21 
 
 		 311 aa  544  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216012  decreased coverage  0.00438376 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0185  periplasmic solute binding protein  57.81 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.00587862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  28.64 
 
 		 297 aa  92.4  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  31.33 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  24.53 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  25.77 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  23.91 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  23.91 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  23.26 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  26.01 
 
 		 318 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.33 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  27.2 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  27.42 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  27.83 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  24.29 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  24.82 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  27.38 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.48 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  28.03 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.29 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  24.36 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.36 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  24.36 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.36 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.36 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.36 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.94 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.21 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.36 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  35.24 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.93 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.52 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.52 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.52 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.52 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  25.1 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.1 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.94 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.22 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.74 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.16 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.76 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.75 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.14 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  25.12 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.25 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.17 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  26.5 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  30.51 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  29.2 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  31.67 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.73 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  24.72 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  22.54 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  23.56 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  35.71 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  30.97 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.75 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  31.68 
 
 		 369 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  22.81 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  34.94 
 
 		 365 aa  53.9  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  24.28 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0057  periplasmic solute binding protein  24.88 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  25.94 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  23.55 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.72 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 509 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  24.3 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  26.54 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2380  periplasmic solute binding protein  22.78 
 
 		 514 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  23.79 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  25.62 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  31.63 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  29.33 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  30.77 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25.47 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  23.4 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0199  periplasmic solute binding protein  28.95 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  25.74 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  25.65 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 		 462 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>