156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_2032 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2032  ABC zinc transporter, periplasmic solute binding protein ZnuA  100 
 
 		 311 aa  642    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216012  decreased coverage  0.00438376 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2335  periplasmic solute binding protein  85.21 
 
 		 309 aa  544  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0185  periplasmic solute binding protein  55.98 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.00587862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  29.02 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  26.1 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  25.81 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 313 aa  86.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  23.9 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  25.61 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  22.97 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  22.1 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  25.76 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  22.1 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  24.39 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.2 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  26.98 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  25.37 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  25.74 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  26.14 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  24.89 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  26 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.79 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.5 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.5 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  23.5 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.5 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  23.5 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.5 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  25.56 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.5 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.69 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.08 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.19 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  21.01 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  26.53 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.19 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.19 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.19 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.19 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.17 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  28.45 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.44 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  27.16 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.7 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  26.75 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.88 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  23.55 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 378 aa  57  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  24.42 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  23.94 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.49 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  21.86 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  22.84 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  22.48 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  27.91 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  31.5 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  23.93 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3888  periplasmic solute binding protein  31.3 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24.19 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  25.3 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1793  putative carbon storage regulator-like protein  30.77 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.265514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  26.27 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  28.71 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  24.84 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  30.09 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 509 aa  50.4  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  27.12 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.17 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3938  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.165215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2836  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  22.41 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 319 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  24.05 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  23.77 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  23.03 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  40 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  21.72 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  25 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  23.04 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  26.74 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>