More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1872 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  95.95 
 
 
74 aa  138  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  52.11 
 
 
73 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  37.14 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  34.78 
 
 
91 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  36.23 
 
 
91 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  41.54 
 
 
1196 aa  59.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  37.84 
 
 
742 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
69 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  37.1 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 
91 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  35.21 
 
 
100 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  33.82 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  36.07 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.92 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  32.39 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  33.8 
 
 
744 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  32.39 
 
 
91 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  34.43 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  31.94 
 
 
91 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  32.88 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03117  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  39.06 
 
 
1211 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.208489  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  36.62 
 
 
833 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  34.43 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.51 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.51 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  32.79 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  34.25 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  30.65 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.26 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.26 
 
 
67 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  32.88 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
759 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
759 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
759 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  36.62 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
938 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  32.39 
 
 
102 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  36.11 
 
 
98 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  30.88 
 
 
95 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  30.88 
 
 
95 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  39.06 
 
 
67 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  34.33 
 
 
1182 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  29.41 
 
 
758 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
802 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
723 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.88 
 
 
954 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
752 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
889 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  38.98 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  38.98 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
826 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
837 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  39.29 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  34.43 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  34.29 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
838 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  33.82 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  30.88 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
827 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  29.23 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  30.16 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
837 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
753 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  30 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  30.88 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 
473 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
946 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
925 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
885 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
871 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  30.88 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 
861 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  33.87 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.23 
 
 
889 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
750 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  33.8 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>