More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1181 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  100 
 
 
1134 aa  2332    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  33.56 
 
 
1148 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.88 
 
 
1141 aa  365  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.27 
 
 
1139 aa  364  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
1138 aa  363  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.47 
 
 
1149 aa  360  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
1151 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
1151 aa  350  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
1093 aa  313  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.87 
 
 
1291 aa  309  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
1160 aa  305  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.33 
 
 
1089 aa  298  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.41 
 
 
1048 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 
1063 aa  284  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.47 
 
 
1117 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.49 
 
 
1081 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.17 
 
 
1080 aa  274  9e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.94 
 
 
1175 aa  270  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
1142 aa  265  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.74 
 
 
1105 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.29 
 
 
1094 aa  260  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 
1227 aa  258  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.33 
 
 
1122 aa  254  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.94 
 
 
1422 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.79 
 
 
1055 aa  251  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
1429 aa  245  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 
1014 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.44 
 
 
1053 aa  227  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.13 
 
 
1271 aa  225  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 
1046 aa  225  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.84 
 
 
1050 aa  224  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.84 
 
 
1050 aa  224  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.2 
 
 
1403 aa  218  8e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.59 
 
 
1055 aa  210  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
1403 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 
1065 aa  207  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 
1037 aa  207  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.25 
 
 
1123 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.18 
 
 
1441 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
1198 aa  204  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.11 
 
 
1377 aa  201  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.54 
 
 
1360 aa  200  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  26.71 
 
 
1043 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 
1295 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
1298 aa  189  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
1402 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.89 
 
 
1226 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 
1023 aa  174  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1096 aa  172  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.76 
 
 
1133 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.89 
 
 
1190 aa  166  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1204 aa  165  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 
1398 aa  161  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.72 
 
 
1264 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.7 
 
 
1169 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.81 
 
 
1285 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.09 
 
 
1153 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
1027 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 
1027 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.95 
 
 
1130 aa  148  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27 
 
 
1087 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
1027 aa  146  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.51 
 
 
914 aa  142  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 
864 aa  137  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 
1342 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
1349 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
1349 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  24.79 
 
 
1353 aa  135  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  25.41 
 
 
1213 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
954 aa  134  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
859 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  25.41 
 
 
1350 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  25.41 
 
 
1359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  25.41 
 
 
1359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  37.56 
 
 
518 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
1359 aa  132  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
1311 aa  132  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
1349 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  25.23 
 
 
1359 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 
1190 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  25.78 
 
 
1348 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.23 
 
 
1359 aa  131  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.01 
 
 
861 aa  131  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 
956 aa  131  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 
860 aa  129  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
744 aa  128  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
858 aa  127  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.65 
 
 
611 aa  127  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 
1340 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  37.09 
 
 
320 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  37.09 
 
 
320 aa  127  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.41 
 
 
971 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
696 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 
911 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.45 
 
 
1358 aa  125  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 
735 aa  124  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.68 
 
 
1207 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.98 
 
 
1020 aa  123  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
641 aa  122  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 
752 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>