297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3663 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  54.58 
 
 		 704 aa  791    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  51.86 
 
 		 747 aa  766    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  53.29 
 
 		 699 aa  776    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  54.72 
 
 		 704 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  45.92 
 
 		 702 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  47.95 
 
 		 700 aa  639    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  45.67 
 
 		 726 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  47.14 
 
 		 701 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  47.79 
 
 		 701 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  50.14 
 
 		 696 aa  707    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  54.87 
 
 		 705 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  54.3 
 
 		 704 aa  790    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1511    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  53.88 
 
 		 699 aa  783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  54.14 
 
 		 699 aa  780    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  54.3 
 
 		 704 aa  790    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  53.86 
 
 		 699 aa  777    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  52.89 
 
 		 709 aa  759    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  52.86 
 
 		 703 aa  764    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  46.35 
 
 		 709 aa  633  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  46.33 
 
 		 727 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  45.26 
 
 		 716 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  43.45 
 
 		 701 aa  611  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  45.15 
 
 		 702 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  45.15 
 
 		 702 aa  598  1e-169  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  46.87 
 
 		 553 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  33.8 
 
 		 933 aa  409  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  37.89 
 
 		 449 aa  313  7.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  35.95 
 
 		 455 aa  279  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 439 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  27.96 
 
 		 447 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  28.08 
 
 		 430 aa  163  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 252 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  26.81 
 
 		 1020 aa  134  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 252 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  29.4 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  30.45 
 
 		 446 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.2 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  27.23 
 
 		 766 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  27.61 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  27.91 
 
 		 416 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  29.4 
 
 		 442 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.46 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  28.53 
 
 		 442 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  28 
 
 		 439 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.76 
 
 		 487 aa  107  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  29.14 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  28.39 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  28.77 
 
 		 436 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  28.77 
 
 		 436 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  28.77 
 
 		 436 aa  102  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  30.58 
 
 		 506 aa  101  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  29.82 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.85 
 
 		 444 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  26.16 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 		 416 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.85 
 
 		 446 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  30.21 
 
 		 437 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  31.38 
 
 		 424 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  29.35 
 
 		 819 aa  97.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  28.25 
 
 		 430 aa  95.5  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  27.3 
 
 		 429 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 280 aa  92.4  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  26.81 
 
 		 448 aa  92.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  30.08 
 
 		 425 aa  91.3  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  24.5 
 
 		 434 aa  90.5  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  26.13 
 
 		 428 aa  90.5  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  25.22 
 
 		 398 aa  90.1  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  26.33 
 
 		 425 aa  89.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  26.67 
 
 		 432 aa  88.6  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.14 
 
 		 409 aa  88.6  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.22 
 
 		 429 aa  88.2  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  25.28 
 
 		 436 aa  88.2  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  29.72 
 
 		 398 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  26.96 
 
 		 437 aa  87.8  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  24.94 
 
 		 395 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  28.2 
 
 		 444 aa  86.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  29.74 
 
 		 386 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  28.27 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  27.01 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  28.62 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  23.92 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  28.43 
 
 		 412 aa  83.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  27.49 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  28.97 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  26.3 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  27.51 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  26.76 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  27.19 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  27.3 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  27.92 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  24.72 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  25.74 
 
 		 430 aa  80.5  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  26.33 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  34.45 
 
 		 414 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  24.4 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  25.83 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  26.24 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>