More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3356 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  100 
 
 		 276 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  34.06 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 281 aa  176  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.37 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  30.37 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  29.81 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  33.66 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.6 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.53 
 
 		 351 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 407 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03213  hypothetical protein  41.84 
 
 		 161 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000858892  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  36.02 
 
 		 352 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 412 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  30.59 
 
 		 425 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  30.96 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.29 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27.19 
 
 		 408 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  27.31 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.79 
 
 		 455 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  26.81 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.38 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.8 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  31.91 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  31.55 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 353 aa  95.9  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 397 aa  94.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  30.53 
 
 		 415 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.82 
 
 		 283 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.32 
 
 		 517 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  29.26 
 
 		 369 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  30.57 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  30.1 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.74 
 
 		 279 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  30.32 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.8 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.37 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  26.56 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  27.39 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  29.79 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  29.79 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.31 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  30.94 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.68 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  24.81 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  29.26 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  24.81 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.59 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.83 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  27.8 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.1 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  27.5 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  27.5 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.81 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  26.77 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  25.38 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  25.82 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  25.93 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  21.67 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  31.85 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  26.61 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.44 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  30.17 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 512 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  35.61 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70580  hypothetical protein  27.62 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  27.62 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  28.38 
 
 		 716 aa  73.6  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.04 
 
 		 470 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  26.32 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  29.86 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>