153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3045 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  100 
 
 		 266 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  54.88 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1504  flagellar assembly protein H  43.67 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  36.67 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  35.22 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1344  flagellar assembly protein H  37.14 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  41.87 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  36.48 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  34.9 
 
 		 324 aa  148  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  36.07 
 
 		 316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  36.03 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  36.32 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  32.35 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  36.03 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2924  flagellar assembly protein H  36.03 
 
 		 338 aa  146  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3226  flagellar assembly protein H  39.9 
 
 		 316 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  35.63 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1363  flagellar assembly protein FliH  33.33 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  34.29 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  35.78 
 
 		 403 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  31.51 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2306  flagellar assembly protein H  35.27 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1326  flagellar assembly protein H  30.99 
 
 		 375 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  34.26 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  29.74 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  29.76 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  34.76 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  32.65 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3474  flagellar assembly protein H  29.26 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  31.9 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  31.53 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.91 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  24.05 
 
 		 349 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  29.06 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  30.37 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  32.62 
 
 		 251 aa  89.7  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  29.59 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3657  flagellar assembly protein H  31.55 
 
 		 235 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 264 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  29.08 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3977  flagellar assembly protein H  29.65 
 
 		 236 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  26.42 
 
 		 226 aa  85.5  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.48 
 
 		 245 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0232  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.310336 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0713  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0075  flagellar assembly protein H  31.32 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  26.4 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  28.64 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  28.64 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  25.27 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  28.66 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  28.26 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.9 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  27.78 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0633  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  27.06 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  26.94 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1708  flagellar assembly protein FliH  26.91 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.246476  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  28.72 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2716  flagellar assembly protein H  26.91 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  28.91 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1244  flagellar assembly protein H  26.46 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2173  flagellar assembly protein H  26.46 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.125202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1702  flagellar assembly protein H  26.46 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  29.12 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  26.11 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  26.67 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0225  flagellar assembly protein H  26.52 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2531  flagellar assembly protein H  27.12 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3446  flagellar assembly protein FliH  28.4 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  25.14 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0173  flagellar assembly protein H  26.52 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2292  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2012  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2393  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0211939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  28.14 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1722  polar flagellar assembly protein FliH  23.46 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  27.98 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  23.08 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  33.1 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1722  polar flagellar assembly protein FliH  23.05 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  26.19 
 
 		 227 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  29.79 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.575281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>