109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1909 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 
408 aa  829    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  59.24 
 
 
400 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  60.25 
 
 
417 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  60.56 
 
 
401 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  31.97 
 
 
383 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  32.41 
 
 
387 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  29.95 
 
 
381 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  33.24 
 
 
389 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  29.87 
 
 
379 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  28.72 
 
 
376 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  30.68 
 
 
373 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  26.3 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  26.85 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  27.68 
 
 
395 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  30 
 
 
395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  28.8 
 
 
379 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  29.89 
 
 
365 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  25.86 
 
 
396 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.64 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.07 
 
 
396 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.88 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  30.42 
 
 
416 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  26.54 
 
 
1101 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  26.32 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  25.99 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  26.32 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  30.36 
 
 
379 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  27.91 
 
 
1852 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  23.85 
 
 
932 aa  87.4  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  26.47 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  22.25 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3551  hypothetical protein  28.03 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  24.51 
 
 
629 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3518  hypothetical protein  26.35 
 
 
400 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.49503  normal  0.689004 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1139  hypothetical protein  27.42 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1816  protein of unknown function DUF1745  28.53 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.988519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1883  hypothetical protein  22.91 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3141  hypothetical protein  25.75 
 
 
460 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  23.08 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  22.45 
 
 
931 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  22.83 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1925  hypothetical protein  27.17 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.795435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2201  domain of unknown function DUF1745  27.17 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4193  domain of unknown function DUF1745  27.82 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  23.22 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  22.47 
 
 
501 aa  72  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  22.96 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  26.23 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4519  domain of unknown function DUF1745  28.13 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  20.67 
 
 
934 aa  69.7  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1872  hypothetical protein  21.55 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  21.51 
 
 
933 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  22.63 
 
 
468 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  22.97 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3344  hypothetical protein  24.93 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2940  hypothetical protein  27.91 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00513133 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1527  hypothetical protein  25.72 
 
 
390 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.039182 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  22.69 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2675  hypothetical protein  25.98 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0296571  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  24.29 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  22.4 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2881  hypothetical protein  25.72 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3617  hypothetical protein  25.87 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0308687  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  24.57 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  25.13 
 
 
389 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  24.46 
 
 
368 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  22.51 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  25.79 
 
 
386 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  23.83 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  25.79 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1661  hypothetical protein  23.58 
 
 
384 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  23.81 
 
 
386 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1717  hypothetical protein  23.58 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1924  hypothetical protein  23.58 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2313  GfdT protein  23.58 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0600  hypothetical protein  23.58 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0710  hypothetical protein  23.58 
 
 
384 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2479  hypothetical protein  24.2 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.492023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2230  hypothetical protein  23.58 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3668  hypothetical protein  26.13 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432885  hitchhiker  0.00253652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1931  hypothetical protein  25.55 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3362  hypothetical protein  22.34 
 
 
377 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  21.35 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  24.62 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.97 
 
 
512 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  22.98 
 
 
806 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  24.8 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  24.32 
 
 
383 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  23.29 
 
 
395 aa  50.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  28.37 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2353  hypothetical protein  25.87 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.18015  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  26.67 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0700  hypothetical protein  22.43 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  0.0832434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0526  hypothetical protein  24.11 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.47 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  22.82 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  25.91 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  27.39 
 
 
383 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  22.57 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0688  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.32 
 
 
951 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00399648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>