More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1341 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  79.95 
 
 
441 aa  652  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  8.14045e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  78.73 
 
 
441 aa  641  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  4.33758e-06  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  86.88 
 
 
442 aa  705  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  100 
 
 
442 aa  867  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  4.98095e-05  unclonable  1.43333e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  49.89 
 
 
446 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  50.23 
 
 
468 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  52.09 
 
 
444 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  48.75 
 
 
460 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  45.69 
 
 
461 aa  359  6e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  48.28 
 
 
525 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  47.9 
 
 
497 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  48.91 
 
 
478 aa  346  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  48.26 
 
 
478 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  47.86 
 
 
496 aa  343  3e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  48.4 
 
 
471 aa  343  3e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  47.86 
 
 
496 aa  343  3e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  46.82 
 
 
435 aa  338  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  7.56367e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  46.82 
 
 
435 aa  338  9e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  5.97851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  46.47 
 
 
511 aa  338  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  44.7 
 
 
441 aa  338  1e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  46.98 
 
 
487 aa  335  8e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  47.1 
 
 
486 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  47.1 
 
 
515 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  46.87 
 
 
486 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  46.87 
 
 
486 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  47.1 
 
 
515 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  45.26 
 
 
490 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  45.99 
 
 
489 aa  330  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  47.2 
 
 
445 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  46.7 
 
 
482 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  49.4 
 
 
488 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  48.23 
 
 
462 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  45.65 
 
 
476 aa  322  9e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  43.94 
 
 
518 aa  321  1e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  48.89 
 
 
416 aa  320  2e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  46.21 
 
 
458 aa  319  6e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  43.94 
 
 
506 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  48.88 
 
 
483 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  47.28 
 
 
408 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  46.75 
 
 
437 aa  313  3e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  46.42 
 
 
461 aa  312  6e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  46.62 
 
 
416 aa  312  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  45.7 
 
 
414 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  47.07 
 
 
435 aa  310  3e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  46.96 
 
 
447 aa  310  3e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  46.1 
 
 
449 aa  310  3e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  43.93 
 
 
433 aa  305  1e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  44.26 
 
 
417 aa  304  2e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  43.72 
 
 
408 aa  304  2e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  43.47 
 
 
416 aa  302  8e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  43.47 
 
 
416 aa  302  8e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  45.43 
 
 
426 aa  302  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  43.47 
 
 
416 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  46.51 
 
 
421 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  44.44 
 
 
446 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  41.98 
 
 
469 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  44.67 
 
 
509 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  43.47 
 
 
416 aa  300  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  43.86 
 
 
416 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  43.86 
 
 
416 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  43.86 
 
 
416 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  44.11 
 
 
416 aa  299  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  43.72 
 
 
416 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  43.47 
 
 
416 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  47.04 
 
 
440 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  43.67 
 
 
416 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  44.62 
 
 
439 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  44.35 
 
 
507 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  44.74 
 
 
584 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  40.68 
 
 
1209 aa  294  3e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  43.9 
 
 
507 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  44.22 
 
 
409 aa  293  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  47.3 
 
 
415 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  44.12 
 
 
506 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0079  ammonium transporter  45.68 
 
 
416 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.376757  normal  0.798164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  43.72 
 
 
416 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  44.61 
 
 
409 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  41.01 
 
 
495 aa  289  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1340  ammonium transporter  46.34 
 
 
417 aa  288  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2407  ammonium transporter  46.57 
 
 
414 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  46.8 
 
 
414 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  41.56 
 
 
512 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  44.97 
 
 
422 aa  286  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  9.04674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  44.72 
 
 
437 aa  286  6e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  43.72 
 
 
417 aa  284  3e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.03 
 
 
1262 aa  283  5e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  43.87 
 
 
416 aa  283  6e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2904  Rh-like protein/ammonium transporter  45.23 
 
 
416 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  44.39 
 
 
441 aa  281  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2347  Rh-like protein/ammonium transporter  41.56 
 
 
420 aa  280  4e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  45.67 
 
 
381 aa  279  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.32513e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 
717 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  45.36 
 
 
406 aa  276  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0492  Rh-like protein/ammonium transporter  44.95 
 
 
422 aa  275  1e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0233  ammonium transporter  45.57 
 
 
411 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0507426  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0522  Rh family protein/ammonium transporter  44.5 
 
 
423 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  40.8 
 
 
525 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  41.37 
 
 
449 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  40.66 
 
 
433 aa  269  9e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.79 
 
 
1016 aa  268  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>