More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6238 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  94.93 
 
 
375 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  100 
 
 
375 aa  745    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  70.56 
 
 
376 aa  541  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  41.6 
 
 
384 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  38.48 
 
 
381 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  38.06 
 
 
380 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
398 aa  225  8e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
380 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  35.09 
 
 
381 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  36.88 
 
 
371 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
398 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  40.8 
 
 
343 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
382 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
418 aa  175  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.95 
 
 
417 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
381 aa  170  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
360 aa  169  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
366 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  38.16 
 
 
370 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  37.37 
 
 
431 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.4 
 
 
366 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
408 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
387 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
387 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
435 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
434 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
400 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
393 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
386 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
384 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
366 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
377 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.05 
 
 
346 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
346 aa  153  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
428 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
394 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
370 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
370 aa  151  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
385 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  25.13 
 
 
375 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  25.13 
 
 
375 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
397 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
371 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.29 
 
 
381 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
375 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 
384 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
378 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 
420 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
382 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.17 
 
 
372 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.43 
 
 
372 aa  137  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
395 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.6 
 
 
373 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
380 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.63 
 
 
364 aa  132  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.63 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
366 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.69 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06150  glycosyltransferase  32.47 
 
 
382 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369332  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
395 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.58 
 
 
336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.72 
 
 
364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 
437 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
535 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.99 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
383 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  35.01 
 
 
381 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
389 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
381 aa  126  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
358 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.34 
 
 
381 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  36.14 
 
 
464 aa  123  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 
374 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.3 
 
 
430 aa  122  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
364 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4182  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.878038  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
376 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  30.13 
 
 
379 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  23.97 
 
 
374 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  31.38 
 
 
361 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 
433 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>