151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1366 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  131  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  92.19 
 
 
64 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  72.41 
 
 
71 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  74.14 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  70.69 
 
 
72 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  68.97 
 
 
72 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  70.69 
 
 
74 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  70.69 
 
 
67 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  68.97 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  66.1 
 
 
66 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  59.26 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1457  hypothetical protein  44.23 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.634836 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  50.82 
 
 
267 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1715  hypothetical protein  47.46 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0288825  normal  0.111224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1693  hypothetical protein  47.46 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.789904  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1678  hypothetical protein  47.46 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.388169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36.84 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  38.71 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2664  protein of unknown function DUF1289  45.76 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139666  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  46.43 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  41.07 
 
 
56 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0957  hypothetical protein  46.15 
 
 
85 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.283271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1339  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1404  protein of unknown function DUF1289  40.38 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0406631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  51.22 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  52.08 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  48.78 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2035  hypothetical protein  46.34 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  48.08 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1567  hypothetical protein  51.28 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.450531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  45.28 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0317  hypothetical protein  42 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4140  hypothetical protein  41.3 
 
 
106 aa  48.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276441  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  47.62 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  50 
 
 
285 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  46.15 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.421597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  46.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  46.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  46.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  46.94 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  45.28 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  38.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  46.94 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  47.62 
 
 
67 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  44.9 
 
 
89 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  46.34 
 
 
74 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  46.34 
 
 
74 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  41.51 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  47.73 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1179  hypothetical protein  41.18 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  46.34 
 
 
74 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  46.81 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  46.34 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  35.48 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  44.9 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  44.68 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1710  hypothetical protein  45.28 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1281  hypothetical protein  40.48 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.760872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  52.38 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  40.38 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2347  hypothetical protein  47.46 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2961  hypothetical protein  47.46 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38885  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2982  hypothetical protein  47.46 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  44.44 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  41.86 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  42.59 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  49.02 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  49.02 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0270  hypothetical protein  55.88 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2257  hypothetical protein  36 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.640377  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2792  hypothetical protein  47.37 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1581  hypothetical protein  35.09 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000074726  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  37.5 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  41.86 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  44.9 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2083  protein of unknown function DUF1289  41.82 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.333398  normal  0.751471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  42 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  40.82 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0821  hypothetical protein  40.82 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.497837  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3162  hypothetical protein  39.62 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.561476  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1730  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101235  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  49.02 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  43.18 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  37.5 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1303  hypothetical protein  38.78 
 
 
67 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0211609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2312  hypothetical protein  38.78 
 
 
67 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  48 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  45.45 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  53.66 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>