More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2642 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 496 aa  1014    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  98.79 
 
 		 498 aa  1002    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  92.95 
 
 		 487 aa  867    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 449 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 470 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 499 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 		 494 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.6 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.61 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 480 aa  300  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.71 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 492 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.01 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 470 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 485 aa  289  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.99 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.94 
 
 		 482 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.37 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.03 
 
 		 489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.59 
 
 		 489 aa  249  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 469 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 484 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 504 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 503 aa  223  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.68 
 
 		 488 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.6 
 
 		 485 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.9 
 
 		 488 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.87 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 488 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 494 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 504 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 490 aa  207  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 494 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 547 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  29.58 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 478 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.88 
 
 		 490 aa  203  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 504 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  32.24 
 
 		 476 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 493 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  33.89 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  34.1 
 
 		 570 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  30.35 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  30.44 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.64 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.1 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  30.04 
 
 		 495 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 562 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 574 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.3 
 
 		 517 aa  193  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3680  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.25 
 
 		 510 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 480 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  29.02 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 502 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.46 
 
 		 483 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 561 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 564 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  31.05 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.46 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 508 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 520 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 490 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 498 aa  186  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 523 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  30.82 
 
 		 508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.05 
 
 		 480 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>