37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33458 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_33458  predicted protein  100 
 
 		 428 aa  897    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0063707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  30.14 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003059  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  29.66 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1246  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  27.81 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  27.76 
 
 		 291 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1068  hypothetical protein  27.25 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.587377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1343  hypothetical protein  28.65 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02795  hypothetical protein  27.07 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1941  hypothetical protein  25.7 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2147  hypothetical protein  25.28 
 
 		 308 aa  97.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145489  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1978  hypothetical protein  27.05 
 
 		 330 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2321  hypothetical protein  25.75 
 
 		 323 aa  94.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.232737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2146  hypothetical protein  27.72 
 
 		 339 aa  94.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2680  hypothetical protein  26.39 
 
 		 307 aa  93.2  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.827346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2351  hypothetical protein  24.86 
 
 		 325 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.742  normal  0.0697497 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1338  hypothetical protein  25.96 
 
 		 292 aa  88.2  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2073  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.09 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.015476  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0518  hypothetical protein  24.65 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2279  hypothetical protein  23.91 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  24.86 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2469  hypothetical protein  25.49 
 
 		 311 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.566058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2329  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0110  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.43 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.896964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1882  hypothetical protein  25.5 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2652  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  26.51 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1217  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.43 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2715  hypothetical protein  23.91 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2601  hypothetical protein  23.97 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2640  hypothetical protein  23.71 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1745  hypothetical protein  24.23 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00288414 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_3183  predicted protein  23.85 
 
 		 327 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0144015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  32.43 
 
 		 345 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  27.41 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  27.91 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  30.77 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  30.77 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>