More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18665 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_18665  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 473 aa  986    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30421  predicted protein  63.22 
 
 		 464 aa  598  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00410  glycine hydroxymethyltransferase, putative  60.91 
 
 		 499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37794  predicted protein  59.42 
 
 		 455 aa  549  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29554  predicted protein  56.99 
 
 		 525 aa  544  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0601833  normal  0.10114 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8717  predicted protein  58.13 
 
 		 464 aa  537  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54015  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78806  Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial precursor (Serine methylase)  52.29 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03058  glycine hydroxymethyltransferase (Eurofung)  52.07 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67292  serine hydroxymethyltransferase  52.4 
 
 		 470 aa  481  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.148145  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10745  serine hydroxymethyltransferase (Eurofung)  50.11 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194092  normal  0.520763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  51.37 
 
 		 420 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  49.88 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  49.88 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  45.6 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  49.37 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  47.63 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  49.62 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  48.56 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  49.37 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  46.83 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  47.3 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  46.59 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  47.07 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  47.75 
 
 		 420 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  47.65 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  46.38 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  47.3 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  48.87 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  48.87 
 
 		 412 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  46.01 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  46.61 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  44.92 
 
 		 410 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  47.45 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  49.12 
 
 		 415 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  46.62 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  46.05 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  50.86 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  45.48 
 
 		 411 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  44.7 
 
 		 410 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  49.12 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  49.12 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  48.77 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  46.92 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  48.37 
 
 		 415 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  47.95 
 
 		 413 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  47.2 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  44.03 
 
 		 422 aa  362  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  48.37 
 
 		 414 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  43.72 
 
 		 418 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  46.07 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  47.15 
 
 		 410 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  49.5 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  46.98 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  47.06 
 
 		 412 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  43.72 
 
 		 433 aa  361  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  44.57 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  45.73 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  46.4 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  46.28 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  48.36 
 
 		 413 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  47.4 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  47.56 
 
 		 426 aa  360  4e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  46.19 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  46.09 
 
 		 431 aa  360  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  49.5 
 
 		 418 aa  360  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6867  glycine hydroxymethyltransferase  46.28 
 
 		 431 aa  360  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  44.04 
 
 		 418 aa  359  7e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  48.54 
 
 		 417 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  48.54 
 
 		 417 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  48.5 
 
 		 417 aa  359  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  46.61 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  45.48 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  44.47 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  46.4 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  48.1 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  50.37 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  48.86 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  45.72 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  48.51 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  46.05 
 
 		 434 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  45.95 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  46.05 
 
 		 434 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  46.09 
 
 		 432 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  44.09 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  43.71 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3274  serine hydroxymethyltransferase  46.77 
 
 		 412 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000462006  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  45.71 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  46.65 
 
 		 438 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  48.26 
 
 		 423 aa  356  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  49.62 
 
 		 429 aa  355  6.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  47.37 
 
 		 438 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  48.01 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  48.1 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  41.87 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  45.39 
 
 		 412 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  45.74 
 
 		 417 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  45.6 
 
 		 434 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  47.49 
 
 		 414 aa  354  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  49.25 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>