34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56484 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_56484  precursor of cyclase lycopene beta cyclase  100 
 
 		 659 aa  1372    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00169655  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  32.55 
 
 		 528 aa  226  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09161  putative lycopene beta cyclase  30.3 
 
 		 408 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0688  lycopene cyclase (CrtL-type)  29.86 
 
 		 414 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.103999  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11541  putative lycopene beta cyclase  30.3 
 
 		 403 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0749733  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15221  putative lycopene beta cyclase  29.67 
 
 		 414 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11261  putative lycopene beta cyclase  32.47 
 
 		 407 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.479015 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1941  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.64 
 
 		 412 aa  180  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2062  lycopene cyclase (CrtL-type)  30.05 
 
 		 411 aa  177  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2643  lycopene cyclase family protein  32.3 
 
 		 413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11691  putative lycopene beta cyclase  31.31 
 
 		 403 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.451912  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1075  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.46 
 
 		 403 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11701  putative lycopene beta cyclase  30.16 
 
 		 403 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06891  putative lycopene epsilon cyclase  31.19 
 
 		 422 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.895812  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06601  putative lycopene epsilon cyclase  30.9 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0633  lycopene cyclase (CrtL-type)  31.19 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06991  putative lycopene epsilon cyclase  31.74 
 
 		 427 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.28746  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0073  lycopene cyclase (CrtL-type)  32.7 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06951  putative lycopene epsilon cyclase  31.83 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07411  putative lycopene epsilon cyclase  31.28 
 
 		 427 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0418129  normal  0.37911 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43511  predicted protein  30.48 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.746424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2711  lycopene cyclase family protein  31.35 
 
 		 413 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23511  putative lycopene epsilon cyclase  31.44 
 
 		 426 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0724  lycopene cyclase, beta and epsilon  29.59 
 
 		 407 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0857  lycopene cyclase, beta and epsilon  27.45 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.27031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0950  lycopene cyclase family protein  25.97 
 
 		 401 aa  107  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.75613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5914  lycopene cyclase family protein  26.72 
 
 		 399 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2394  lycopene cyclase family protein  26.57 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.990938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5144  lycopene cyclase family protein  25.13 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0091  Lycopene beta and epsilon cyclase  27.55 
 
 		 382 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.457408  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2495  Lycopene beta and epsilon cyclase  28.28 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.693198  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2038  lycopene beta and epsilon cyclase  31.01 
 
 		 417 aa  48.9  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  24.77 
 
 		 455 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3568  Lycopene beta and epsilon cyclase  25.49 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>