85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40462 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  100 
 
 
508 aa  1041    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54319  predicted protein  30.53 
 
 
607 aa  210  4e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49602  predicted protein  34.2 
 
 
558 aa  185  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  34.02 
 
 
399 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 
275 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 
843 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.39 
 
 
474 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.28 
 
 
272 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 
270 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.2 
 
 
841 aa  93.6  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  31.87 
 
 
702 aa  91.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.19 
 
 
494 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_7679  predicted protein  48.15 
 
 
105 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.04 
 
 
261 aa  90.1  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.19 
 
 
247 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.7 
 
 
275 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.23 
 
 
552 aa  89.7  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45961  predicted protein  28.92 
 
 
366 aa  87.8  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.84 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.73 
 
 
713 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  31.45 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5868  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  30.8 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  31.02 
 
 
582 aa  80.5  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  29.49 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.15 
 
 
650 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  31.34 
 
 
443 aa  77  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  30.09 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_7168  predicted protein  34.72 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000611936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1254  putative trypsin  29.96 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000770222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2703  serine protease  34.27 
 
 
298 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363815  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  27.2 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  30.08 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0194  conserved repeat domain protein  28.24 
 
 
543 aa  70.1  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  28.98 
 
 
538 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10090  secreted trypsin-like serine protease  28.64 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.811514 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2275  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.45 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  27.53 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.79 
 
 
554 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.91 
 
 
432 aa  67  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2220  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.08 
 
 
307 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231709  hitchhiker  0.00133623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.84 
 
 
260 aa  64.3  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0423  exported serine protease, trypsin elastase  25.85 
 
 
323 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  28.35 
 
 
759 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.65 
 
 
227 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.14 
 
 
264 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1979  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.95 
 
 
234 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2105  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.35 
 
 
255 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 
227 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 
254 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0431  putative serine protease  28 
 
 
330 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.410989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  29.65 
 
 
278 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 
271 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0828  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.34 
 
 
297 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5250  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 
467 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 
255 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5451  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.83 
 
 
338 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.648016  normal  0.239065 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2825  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.06 
 
 
314 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.56 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1812  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.34 
 
 
253 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1171  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 
255 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208534  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5572  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.23 
 
 
259 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.23 
 
 
251 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  24.84 
 
 
1028 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.83 
 
 
257 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4609  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.32 
 
 
251 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.88 
 
 
300 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0650  putative serine protease  27.42 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  33.33 
 
 
539 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.06 
 
 
732 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.25 
 
 
248 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.262697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.49 
 
 
257 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  24.2 
 
 
1096 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  27.66 
 
 
392 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  32.14 
 
 
538 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.91 
 
 
253 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 
303 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.18 
 
 
465 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004369  secreted trypsin-like serine protease  25.65 
 
 
388 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>