More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_15374 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_15374  predicted protein  100 
 
 		 442 aa  917    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1971  seryl-tRNA synthetase  51.09 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.140828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  54.67 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  50.37 
 
 		 427 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1722  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2353  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 426 aa  388  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.17 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 435 aa  386  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1686  seryl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.162047 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.03 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  55.46 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2257  seryl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  47.9 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 429 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 426 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  46.81 
 
 		 427 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02111  seryl-tRNA synthetase  48 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000240259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  53.89 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 427 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  52.77 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  53.22 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1159  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  51.25 
 
 		 434 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3115  seryl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 430 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  53.06 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0692  seryl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.96441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 424 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  50.66 
 
 		 426 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  51.66 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>