More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2033 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  100 
 
 
462 aa  937    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  58.89 
 
 
482 aa  543  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  60 
 
 
477 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  57.39 
 
 
482 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  58.32 
 
 
480 aa  527  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  57.82 
 
 
480 aa  525  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  57.97 
 
 
483 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.52 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  55.29 
 
 
503 aa  507  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.02 
 
 
469 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  56.64 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  55.75 
 
 
469 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  55.26 
 
 
471 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  55.75 
 
 
469 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  54.7 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.12 
 
 
466 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  54 
 
 
464 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  54.05 
 
 
470 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.19 
 
 
467 aa  481  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55 
 
 
466 aa  478  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.74 
 
 
465 aa  478  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  56.39 
 
 
469 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.36 
 
 
761 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  54.01 
 
 
464 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  55.1 
 
 
469 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  52.72 
 
 
465 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  55.85 
 
 
468 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  55.14 
 
 
463 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.62 
 
 
463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  52.83 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.17 
 
 
463 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  52.36 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  52.37 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  52.12 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.42 
 
 
457 aa  463  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.31 
 
 
480 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  56.24 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  52.86 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  52.89 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  52.59 
 
 
468 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.3 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.22 
 
 
1005 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  52.37 
 
 
468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.76 
 
 
1011 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.98 
 
 
1008 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.77 
 
 
994 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.61 
 
 
465 aa  442  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.59 
 
 
497 aa  442  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.76 
 
 
1011 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  51.17 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  51.75 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.13 
 
 
476 aa  441  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  50.11 
 
 
477 aa  438  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  50.86 
 
 
481 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  51.09 
 
 
474 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  51.29 
 
 
473 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.57 
 
 
464 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.24 
 
 
461 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  51.76 
 
 
473 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.62 
 
 
458 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  48.71 
 
 
467 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.18 
 
 
447 aa  418  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.33 
 
 
448 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.22 
 
 
994 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  49.03 
 
 
469 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  50.34 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  50.22 
 
 
747 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  49.2 
 
 
446 aa  394  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.96 
 
 
947 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  48.06 
 
 
944 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  48.3 
 
 
942 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  47.82 
 
 
944 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  47.57 
 
 
944 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.48 
 
 
438 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.85 
 
 
483 aa  328  9e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  41.21 
 
 
465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  41.07 
 
 
465 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0729  glutamate synthase, small subunit  39 
 
 
465 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0877  glutamate synthase, small subunit  39 
 
 
465 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.44066  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  39.55 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  40.14 
 
 
699 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2764  glutamate synthase subunit beta  37.28 
 
 
469 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  39.82 
 
 
440 aa  296  5e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.75 
 
 
1126 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3019  glutamate synthase subunit beta  37.01 
 
 
468 aa  293  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3509  glutamate synthase subunit beta  37.55 
 
 
472 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03078  glutamate synthase, 4Fe-4S protein, small subunit  37.34 
 
 
472 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03029  hypothetical protein  37.34 
 
 
472 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0487  glutamate synthase subunit beta  37.34 
 
 
472 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3406  glutamate synthase subunit beta  37.34 
 
 
472 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  38.36 
 
 
472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0157845 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0494  glutamate synthase, small subunit  37.34 
 
 
472 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3557  glutamate synthase subunit beta  37.34 
 
 
472 aa  289  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.65 
 
 
445 aa  288  1e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4536  glutamate synthase subunit beta  37.55 
 
 
472 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  38.46 
 
 
469 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4113  glutamate synthase, small subunit  37.17 
 
 
473 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.28 
 
 
658 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0412  glutamate synthase subunit beta  39.41 
 
 
472 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2682  glutamate synthase subunit beta  38.51 
 
 
483 aa  286  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.287891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>