More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0794 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  100 
 
 
786 aa  1640    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  44.3 
 
 
772 aa  624  1e-177  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
768 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  42.76 
 
 
773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  40.13 
 
 
762 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  41.13 
 
 
794 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  41.51 
 
 
740 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  39.95 
 
 
785 aa  522  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  41.06 
 
 
767 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.96 
 
 
743 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  39.05 
 
 
786 aa  512  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  40.16 
 
 
765 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.69 
 
 
850 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  39.66 
 
 
759 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  37.78 
 
 
776 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  38.9 
 
 
854 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.43 
 
 
815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.28 
 
 
783 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
821 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 
787 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  34.84 
 
 
838 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
870 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
857 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 
841 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
834 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
774 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  36.5 
 
 
826 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 
850 aa  399  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
743 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 
862 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.39 
 
 
907 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 
730 aa  393  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
743 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
810 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
743 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  34.9 
 
 
846 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 
858 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  35.31 
 
 
742 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.68 
 
 
888 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  34.85 
 
 
755 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 
750 aa  390  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 
857 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 
857 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 
732 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 
787 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
846 aa  382  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
728 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  35.41 
 
 
844 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  35.41 
 
 
844 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 
839 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  35.41 
 
 
928 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  35.41 
 
 
839 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
846 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  35.41 
 
 
844 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.41 
 
 
844 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  33.73 
 
 
752 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  33.42 
 
 
762 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 
801 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.8 
 
 
698 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  33.11 
 
 
760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
678 aa  312  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
675 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  27.78 
 
 
841 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  28.03 
 
 
795 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  29.04 
 
 
805 aa  267  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  26.92 
 
 
818 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  27.5 
 
 
835 aa  266  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  27.2 
 
 
829 aa  266  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  27.38 
 
 
809 aa  265  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  28.57 
 
 
808 aa  264  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.18 
 
 
773 aa  261  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.44 
 
 
827 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  27.65 
 
 
796 aa  260  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28 
 
 
794 aa  258  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  27.87 
 
 
794 aa  256  9e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  27.92 
 
 
818 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  28.22 
 
 
799 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  27.02 
 
 
819 aa  254  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  28.7 
 
 
847 aa  252  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  27.65 
 
 
824 aa  252  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  27.02 
 
 
818 aa  253  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  28.2 
 
 
799 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  28.09 
 
 
796 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  28.41 
 
 
801 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  27.24 
 
 
797 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  26.46 
 
 
832 aa  251  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  28.96 
 
 
777 aa  251  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  29.29 
 
 
778 aa  250  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  28.42 
 
 
777 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  28.42 
 
 
777 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  27.3 
 
 
810 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  27.24 
 
 
797 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  27.89 
 
 
779 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  27.48 
 
 
766 aa  248  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  26.98 
 
 
797 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  27.63 
 
 
794 aa  248  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  27.82 
 
 
838 aa  248  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  27.87 
 
 
819 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  28.02 
 
 
833 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  27.79 
 
 
792 aa  247  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>